هذا هو الأمر الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
afetch - استرداد محاذاة من قاعدة بيانات محاذاة
موجز
بعد ذلك [خيارات] محاذاة مفتاح
بعد ذلك --فهرس محاذاة
الوصف
بعد ذلك يسترد المحاذاة المسماة مفتاح من قاعدة بيانات محاذاة في الملف محاذاة
محاذاة هو ملف "متعدد المحاذاة" في ستوكهولم (على سبيل المثال Pfam الأصلي)
تنسيق.
مفتاح هو إما اسم (ID) المحاذاة ، أو رقم انضمامها (AC).
تشير محاذاة يجب أولاً أن يكون ملف SSI مفهرسًا بـ بعد ذلك --فهرس من أجل الكفاءة
استرجاع. فهرس SSI ليس مطلوبًا ، ولكن استرجاع المحاذاة بدونه قد يكون مطلوبًا
بطيئة مؤلمة.
OPTIONS
-h طباعة تعليمات موجزة ؛ يتضمن رقم الإصدار وملخصًا لجميع الخيارات ، بما في ذلك
خيارات الخبراء.
EXPERT OPTIONS
--فهرس
بدلاً من استرجاع ملف مفتاح، الأمر الخاص بعد ذلك --فهرس محاذاة
ينتج فهرس SSI للأسماء والمدخلات الخاصة بالمحاذاة في الملف
محاذاة يجب تشغيل هذا مرة واحدة على محاذاة ملف لتحضيره للجميع
afetch المستقبل.
استخدم afetch عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net