beast-mcmc - عبر الإنترنت في السحابة

برنامج:

اسم

beast-mcmc - أشجار أخذ العينات للتحليل التطوري بايزي

موجز

الوحش mcmc [OPTIONS] [المدخلات. xml]

الوحش mcmc [-إفراط | -صارم | -نافذة او شباك | -خيارات | -العمل | -بذرة | -الخطأ i |
-الخيوط i | -جافا | -بيجل | -beagle_info | -beagle_resource_order | -مساعدة |
المدخلات. xml]

الوصف

BEAST هو برنامج متعدد المنصات لتحليل Bayesian MCMC للتسلسلات الجزيئية. إنها
موجهة نحو السلالات المتجذرة والمقاسة بالوقت والمستنتجة باستخدام صارم أو مريح
نماذج الساعة الجزيئية. الغرض منه هو أن يكون وسيلة لإعادة بناء السلالات و
كإطار لاختبار الفرضيات التطورية دون اشتراط على شجرة واحدة
البنية. يستخدم BEAST MCMC لحساب متوسط ​​مساحة الشجرة، بحيث يتم وزن كل شجرة
يتناسب مع احتمالها الخلفي. نحن ندرج واجهة مستخدم سهلة الاستخدام
برنامج لإعداد التحليلات القياسية ومجموعة من البرامج لتحليل
نتائج. هناك ثلاثة مجالات بحث رئيسية مخصصة لحزمة BEAUti/BEAST
ينطبق بشكل خاص. هذه المناطق هي سلالات الأنواع للتأريخ الجزيئي،
علم الوراثة السكانية القائم على التلاحم والسكان المتطورين بشكل قابل للقياس (الحمض النووي القديم أو
مجموعات بيانات التسلسل الفيروسي المختومة بالوقت).

OPTIONS

-إفراط
رسائل تحليل XML المطولة

-صارم
فشل في ملف BEAST XML غير المطابق

-نافذة او شباك
توفير نافذة وحدة التحكم

-خيارات
عرض مربع حوار الخيارات

-العمل
تغيير دليل العمل إلى دليل ملف الإدخال

-بذرة
تحديد بذرة مولد رقم عشوائي

-الخطأ i
الحد الأقصى لعدد الأخطاء الرقمية قبل التوقف

-الخيوط i
عدد الخيوط الحسابية المراد استخدامها (الافتراضي 1)

-جافا
استخدم Java فقط، ولا توجد تطبيقات أصلية

-بيجل
استخدم مكتبة بيغل إذا كانت متوفرة

-beagle_info
عرض معلومات عن موارد البيجل المتاحة

-beagle_resource_order
تعيين ترتيب الموارد بيغل

-مساعدة
شاشة استخدام الطباعة

استخدم beast-mcmc عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net