هذا هو الأمر bp_oligo_countp الذي يمكن تشغيله في موفر الاستضافة المجاني OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
bp_oligo_count - عدد القلة وتكرارها
موجز
الاستخدام: bp_oligo_count [-h / - مساعدة] [-l / - طول OLIGOLENGTH]
[-f / - تنسيق SEQFORMAT] [-i / - in / -s / - تسلسل SEQFILE]
[-o / - خارج OUTFILE]
الوصف
تحسب هذه النصوص التكرار والتردد لجميع قليل النوكليوتيدات ذات الطول المحدد.
يمكن استخدامه لتحديد ما هي البادئات المفيدة للتشغيل المتكرر للحمض النووي
لوضع العلامات العشوائية.
لاحظ أنه يمكن تشغيل هذا البرنامج النصي باستخدام برنامج compseq وهو جزء من
زخرف.
OPTIONS
تنسيق التسلسل الافتراضي هو fasta. إذا لم يتم تقديم ملف outfile ، فستتم طباعة النتائج
للمعايير. يمكن إدخال جميع الخيارات الأخرى بشكل تفاعلي.
ردود الفعل
البريدية قوائم
تعد ملاحظات المستخدم جزءًا لا يتجزأ من تطور هذه الوحدة النمطية ووحدات Bioperl الأخرى. يرسل
يفضل أن تكون تعليقاتك واقتراحاتك على قائمة بريد Bioperl. إشتراكك
هو محل تقدير كبير.
[البريد الإلكتروني محمي] - مناقشة عامة
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - حول القوائم البريدية
التقارير البق
أبلغ عن الأخطاء إلى نظام تتبع الأخطاء في Bioperl لمساعدتنا في تتبع الأخطاء و
دقة. يمكن إرسال تقارير الأخطاء عبر الويب:
https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues
AUTHOR - تشارلز C. كيم
البريد الإلكتروني [البريد الإلكتروني محمي]
التاريخ
مكتوب في 2 يوليو 2001
تم تقديمه لمشروع سكربتات bioperl 2001/08/06
>> تحسين سرعة 100 × بواسطة Heikki Lehvaslaiho
استخدم bp_oligo_countp عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
