هذا هو الأمر fahash الذي يمكن تشغيله في موفر الاستضافة المجاني OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
Fahash - منشئ التجزئة التسلسلي لـ PCR الإلكتروني العكسي
موجز
فهاش [-hV] -b ملف التجزئة [-w wdsize] [-f الفترة] [-F fragment_min,fragment_max] [-k] [-c
حجم ذاكرة التخزين المؤقت] [-v 1|2] ملف famap ...
فهاش [-hV] -T ملف التجزئة [-o outfile]
الوصف
البرنامج فهاش يعد جزءًا من مجموعة e-PCR ويستخدم لإنشاء ملفات التجزئة والإخراج
إحصائيات استخدام الكلمات لعمليات البحث العكسية لـ PCR الإلكتروني.
OPTIONS
-b ملف تجزئة
بناء جداول التجزئة (ملف التجزئة) من ملفات التسلسل،
-T ملف تجزئة
طباعة إحصائيات استخدام الكلمات لملف التجزئة
-o ملف
كتابة الإخراج إلى ملف "outfile"
خيارات البناء:
-w حجم الكلمة
ضبط حجم الكلمة عند إنشاء جداول التجزئة
-f فترة
ضبط عدم التواصل عند إنشاء جداول التجزئة
-k تخطي التكرارات عند إنشاء ملف التجزئة
-F الحد الأدنى - الحد الأقصى
تعيين علامات مائية لحجم الجزء (بالميجابايت) (الإصدار 1 فقط)
-c حجم ذاكرة التخزين المؤقت
ضبط حجم ذاكرة التخزين المؤقت (الإصدار 2 فقط)
-v ver استخدام إصدار التنسيق (1|2، 2 هو الإصدار الافتراضي)
مثال
famap -tN -b genome.famap org/chr_*.fa
فهاش -ب جينوم.هاش -w 12 -f3 ${PWD}/genome.famap
إعادة PCR -s genome.hash -n1 -g1 ACTATTGATGATGA AGGTAGATGTTTTTT 120-200
يرى com.famap(1) و إعادة pcr(1)
استخدم الفحش عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
