هذا هو الأمر gmx-view الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة على الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
gmx-view - عرض مسار على محطة X-Windows
موجز
عرض gmx [-f [<.xtc / .trr / ...>]] [-s [<.tpr>]] [-n [<.ndx>]] [-b ]
[-e ] [-dt ]
الوصف
GMX عرض هو عارض مسار GROMACS. يقرأ هذا البرنامج ملف مسار ، تشغيل
ملف الإدخال وملف الفهرس ويرسم بنية ثلاثية الأبعاد للجزيء الخاص بك على المعيار X الخاص بك
نافذة الشاشة. لا حاجة لمحطة عمل رسومات عالية الجودة ، بل إنها تعمل على أحادية اللون
شاشات.
تم تنفيذ الميزات التالية: العرض ثلاثي الأبعاد ، والتناوب ، والترجمة ، والقياس
للجزيء (الجزيئات) ، والملصقات الموجودة على الذرات ، وتحريك المسارات ، والنسخ الورقي في PostScript
التنسيق ، والمرشحات الذرية المعرفة من قبل المستخدم تعمل على MIT-X (الحقيقي X) ، والنوافذ المفتوحة والعزف ، المستخدم
قوائم ودية ، وخيار لإزالة الدورية ، وخيار لإظهار مربع حسابي.
يمكن استخدام بعض خيارات سطر أوامر X الأكثر شيوعًا: -بج, -fg تغيير الألوان -خط
اسم الخط يغير الخط.
OPTIONS
خيارات لتحديد ملفات الإدخال:
-f [<.xtc / .trr / ...>] (traj.xtc)
مسار: نشوة مفاعل طهران البحثي لجنة مناهضة التعذيب غرو g96 فوسفات الحكومة الوطنية الانتقالية
-s [<.tpr>] (topol.tpr)
xdr المحمولة تشغيل ملف الإدخال
-n [<.ndx>] (index.ndx) (اختياري)
ملف الفهرس
خيارات أخرى:
-b (0)
الإطار الأول (ps) للقراءة من المسار
-e (0)
الإطار الأخير (بس) للقراءة من المسار
-dt (0)
استخدم الإطار فقط عندما يكون t MOD dt = المرة الأولى (ps)
معروف قضايا
· خيار الكرات لا يعمل
· في بعض الأحيان يتخلص من اللب دون سبب وجيه
استخدم gmx-view عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
