هذا هو الأمر ipig الذي يمكن تشغيله في موفر الاستضافة المجاني OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
ipig - دمج PSMs في تصورات متصفح الجينوم
موجز
ipig <psm ملف> |-ز|-ج|-كجم [ ]
الوصف
يستهدف iPiG تكامل مطابقات طيف الببتيد (PSMs) من قياس الطيف الكتلي
(MS) تحديدات الببتيد في التصورات الجينومية التي يوفرها متصفح الجينوم مثل
كمتصفح الجينوم UCSC (http://genome.ucsc.edu/).
تأخذ iPiG PSMs من تنسيق MS القياسي mzIdentML (*.mzid) أو بتنسيق نصي و
يوفر نتائج بتنسيقات مسار الجينوم (ملفات BED وGFF3)، والتي يمكن الحصول عليها بسهولة
المستوردة إلى متصفحات الجينوم.
OPTIONS
<psm ملف>
يشير إلى الملف الذي يحتوي على تطابقات طيف الببتيد (mzid/txt)
-g, -Gui
يبدأ واجهة المستخدم الرسومية لـ iPiG
-c, -مراقبة
يبدأ التحكم في الجينات، ويجب الإشارة إلى الملفات الضرورية في التكوين
ملف
-CG, -controlgui
يبدأ واجهة المستخدم الرسومية للتحكم في الجينات
-d, -downloader
يبدأ تحميل واجهة المستخدم الرسومية
يمكن الإشارة إلى ملف تكوين مختلف (وإلا فسيتم تحميل ipig.conf بواسطة
إفتراضي)
متطلبات إضافية:
باستخدام وضع غير واجهة المستخدم الرسومية، يجب أن يحتوي ملف التكوين (ipig.conf افتراضيًا) على عدة ملفات
معلمات إضافية، على سبيل المثال الإشارة إلى الجينوم المرجعي وما إلى ذلك.
في وضع واجهة المستخدم الرسومية (-g -CG)، يمكن الإشارة إلى المعلمات الإضافية بطريقتين، داخل
الواجهة أو مع ملف التكوين أيضًا.
قم بإلقاء نظرة على readme.txt وipig.conf للحصول على أمثلة ومزيد من التفاصيل حول ملف
معلمات إضافية
استخدم ipig عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
