هذا هو الأمر macs2_randsample الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة على الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
macs2_randsample - التحليل المستند إلى نموذج لتسلسل ChIP
الوصف
الاستخدام: macs2 randsample [-h] -t ملف [ملف ...] (-p النسبة المئوية | -n رقم)
[- بذور البذور] [-o OUTPUTFILE] [- Outdir OUTDIR]
[-s TSIZE] [-f {AUTO ، BAM ، SAM ، BED ، ELAND ، ELANDMULTI ، ELANDEXPORT ، BOWTIE}] [- الإسراف
عنكبوتي]
اختياري الحجج:
-h, --مساعدة
إظهار رسالة المساعدة هذه والخروج
-t TFILE [TFILE ...] ، - t ملف ملف [ملف ...]
ملف محاذاة ChIP-seq. إذا تم تقديم عدة ملفات كـ "-t AB C" ، فسيتم ذلك
يجب أن تقرأ جميعًا وتندمج. لاحظ أنه ليس من المفترض أن تعمل بيانات نهاية الزوج مع هذا
أمر. مطلوب.
-p نسبة مئوية، --النسبة المئوية النسبة المئوية
النسبة المئوية للعلامات التي تريد الاحتفاظ بها. إدخال 80.0 لـ 80٪. لا يمكن استخدام هذا الخيار
في نفس الوقت مع -n/ - عدد. مطلوب
-n عدد، --عدد عدد
عدد العلامات التي تريد الاحتفاظ بها. أدخل 8000000 أو 8e + 6 مقابل 8 ملايين. هذا الخيار
لا يمكن استخدامها في نفس الوقت مع -p/--نسبه مئويه. لاحظ أن عدد العلامات في
الناتج تقريبي كالرقم المحدد هنا. مطلوب
--بذرة بذرة
اضبط البذور العشوائية مع خفض بيانات أخذ العينات. يجب أن يكون عددًا صحيحًا غير سالب في
لكي تكون فعالة. افتراضي: غير محدد
-o ملف إلاخراج، - الملف الشخصي ملف إلاخراج
اسم ملف الإخراج BED. إذا لم يتم تحديده ، فسيتم الكتابة إلى الإخراج القياسي. تقصير:
المعياري
--أوتدير في الهواء الطلق
إذا تم تحديد جميع ملفات الإخراج سيتم كتابتها إلى هذا الدليل. الافتراضي: ملف
دليل العمل الحالي
-s TSIZE ، - الحجم الحجم
حجم العلامة. سيؤدي هذا إلى تجاوز حجم العلامة المكتشفة تلقائيًا. الافتراضي: غير محدد
-f {AUTO ، BAM ، SAM ، BED ، ELAND ، ELANDMULTI ، ELANDEXPORT ، BOWTIE} ، --صيغة
{AUTO ، BAM ، SAM ، BED ، ELAND ، ELANDMULTI ، ELANDEXPORT ، BOWTIE}
تنسيق ملف العلامات ، "AUTO" ، "BED" أو "ELAND" أو "ELANDMULTI" أو "ELANDEXPORT" أو
"SAM" أو "BAM" أو "BOWTIE". الخيار التلقائي التلقائي سيقرر macs2 randsample
وهو تنسيق الملف. يرجى التحقق من التعريف في ملف README إذا اخترت
ELAND / ELANDMULTI / ELANDEXPORT / SAM / BAM / BOWTIE. الافتراضي: "تلقائي"
- الإسراف عنابي
تعيين مستوى مطول. 0: إظهار الرسالة الحرجة فقط ، 1: إظهار تحذير إضافي
الرسالة ، 2: إظهار معلومات العملية ، 3: إظهار رسائل التصحيح. إذا أردت أن تعرف
أين هي القراءات المكررة ، استخدم 3. افتراضي: 2
استخدم macs2_randsample عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
