هذه هي عضلة الأوامر التي يمكن تشغيلها في موفر الاستضافة المجاني OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
العضلات - محاذاة تسلسل البروتين المتعدد
موجز
عضلة -في إدخال ملف (فاستا) [-خارج الناتج ملف (إفتراضي فاستا)] [-diags] [-سجل سجل ملف]
[-maxiters n] [- الحد الأقصى للساعات n] [-maxmb m] [-لغة البرمجة] [-أطباء بلا حدود] [-clw] [-clwstrict]
[-سجل [أ] ملف تسجيل] [-هادئ] [-مستقر] [-مجموعة] [-الإصدار]
الوصف
توثق صفحة الدليل هذه بإيجاز ملف عضلة أمر.
عضلة يقوم بمحاذاة تسلسلات البروتين ويعتبر متفوقا وأسرع من Clustal W.
OPTIONS
-في إدخال ملف
المسار إلى ملف الإدخال المنسق FASTA
-خارج الناتج ملف
المسار إلى ملف الإخراج، بتنسيق FASTA افتراضيًا
-diags
البحث عن الأقطار (أسرع للتسلسلات المماثلة)
-maxiters n
الحد الأقصى لعدد التكرارات (عدد صحيح، الافتراضي 16)
- الحد الأقصى للساعات n
الحد الأقصى لوقت التكرار بالساعات (لا يوجد حد افتراضي)
-maxmb m
الحد الأقصى للذاكرة المخصصة بالميجابايت (الافتراضي 80% من ذاكرة الوصول العشوائي)
-لغة البرمجة
كتابة الإخراج بتنسيق HTML (افتراضي FASTA)
-أطباء بلا حدود
كتابة الإخراج بتنسيق MSF (افتراضي FASTA)
-clw
كتابة الإخراج بتنسيق Clustal W (افتراضي FASTA)
-clwstrict
كما -clw، مع رأس ´CLUSTAL W (1.81)´
-سجل [أ] ملف تسجيل
قم بتسجيل الدخول إلى الملف (إلحاق if -loga، والكتابة فوق if -log)
-هادئ
لا تكتب رسائل التقدم إلى stderr
-مستقر
تسلسلات الإخراج بترتيب الإدخال (الافتراضي هو -group)
-مجموعة
تجميع التسلسلات حسب التشابه (هذا هو الإعداد الافتراضي)
-الإصدار
عرض معلومات الإصدار والخروج
استخدم العضلات عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net