العضلات - عبر الإنترنت في السحابة

برنامج:

اسم

العضلات - محاذاة تسلسل البروتين المتعدد

موجز

عضلة -في إدخال ملف (فاستا) [-خارج الناتج ملف (إفتراضي فاستا)] [-diags] [-سجل سجل ملف]
[-maxiters n] [- الحد الأقصى للساعات n] [-maxmb m] [-لغة البرمجة] [-أطباء بلا حدود] [-clw] [-clwstrict]
[-سجل [أ] ملف تسجيل] [-هادئ] [-مستقر] [-مجموعة] [-الإصدار]

الوصف

توثق صفحة الدليل هذه بإيجاز ملف عضلة أمر.

عضلة يقوم بمحاذاة تسلسلات البروتين ويعتبر متفوقا وأسرع من Clustal W.

OPTIONS

-في إدخال ملف
المسار إلى ملف الإدخال المنسق FASTA

-خارج الناتج ملف
المسار إلى ملف الإخراج، بتنسيق FASTA افتراضيًا

-diags
البحث عن الأقطار (أسرع للتسلسلات المماثلة)

-maxiters n
الحد الأقصى لعدد التكرارات (عدد صحيح، الافتراضي 16)

- الحد الأقصى للساعات n
الحد الأقصى لوقت التكرار بالساعات (لا يوجد حد افتراضي)

-maxmb m
الحد الأقصى للذاكرة المخصصة بالميجابايت (الافتراضي 80% من ذاكرة الوصول العشوائي)

-لغة البرمجة
كتابة الإخراج بتنسيق HTML (افتراضي FASTA)

-أطباء بلا حدود
كتابة الإخراج بتنسيق MSF (افتراضي FASTA)

-clw
كتابة الإخراج بتنسيق Clustal W (افتراضي FASTA)

-clwstrict
كما -clw، مع رأس ´CLUSTAL W (1.81)´

-سجل [أ] ملف تسجيل
قم بتسجيل الدخول إلى الملف (إلحاق if -loga، والكتابة فوق if -log)

-هادئ
لا تكتب رسائل التقدم إلى stderr

-مستقر
تسلسلات الإخراج بترتيب الإدخال (الافتراضي هو -group)

-مجموعة
تجميع التسلسلات حسب التشابه (هذا هو الإعداد الافتراضي)

-الإصدار
عرض معلومات الإصدار والخروج

استخدم العضلات عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net