هذه هي أدوات picard للأوامر التي يمكن تشغيلها في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة على الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
أدوات picard - معالجة ملفات SAM و BAM
موجز
أدوات picard COMMAND [OPTION] ...
الوصف
تنسيق SAM (محاذاة التسلسل / الخريطة) هو تنسيق عام لتخزين النوكليوتيدات الكبيرة
محاذاة التسلسل.
تتضمن أدوات Picard هذه الأدوات المساعدة لمعالجة ملفات SAM و BAM:
AddOrReplaceReadGroups
BamToBfq
BamIndexStats
BuildBamIndex
احسب مقاييس الصحة
كلينسام
اجمع المحاذاة الملخص المقاييس
جمعGcBiasMetrics
جمعإدراج حجم القياسات
اجمع MultipleMetrics
جمع TargetedPcrMetrics
اجمع RnaSeqMetrics
قارنSAMs
إنشاء تسلسل قاموس
اختزال العينة
استخراج
تقدير المكتبة التعقيد
FastqToSam
عامل التصفية
معلومات FixMate
IlluminaBasecallsToFastq
IlluminaBasecallsToSam
تحقق من ElluminaDirectory
IntervalListTools
مارك مكررات
يعني الجودة حسب الدورة
MergeBamAlignment
MergeSamFiles
MergeVcfs
تطبيع الفاستا
مقتطفات
QualityScoreDistribution (توزيع نقاط الجودة)
إعادة ترتيب
استبدلسامهيدير
RevertSam
SamFormatConverter
SamToFastq
الترتيب
تنسيق VcfFormatConverter
سبليتفكفس
ValidateSamFile
مشاهدة
التبليغ بق
[البريد الإلكتروني محمي]
حقوق الطبع والنشر
حقوق الطبع والنشر 2010 The Broad Institute
استخدم أدوات picard عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
