هذا هو الأمر Propka الذي يمكن تشغيله في موفر الاستضافة المجاني OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
Propka - ملفات Protonate PDB بناءً على pKa
موجز
بروبكا بروبكاتمب1
الوصف
بروبكا يقوم بأتمتة عملية البروتون (تحديد موضع أيونات الهيدروجين) في هيكل في PDB
تنسيق لأي قيمة pKa معينة. يجب تسمية الملف المراد استخدامه بـ PROPKATMP1 في ملف
الدليل حيث يتم تشغيل Propka.
بروبكا سيتم إنشاء ملفي إخراج باسم PROPKATMP2 وPROPKATMP3. بروبكاتمب2
يحتوي على البنية الناتجة بتنسيق PDB. يحتوي PROPKATMP3 على ملخص لـ
بروبكا يركض.
الاقتباس بروبكا
يرجى الاعتراف باستخدامك لـ بروبكا من خلال الاستشهاد بـ:
هوي لي، وأندرو د. روبرتسون، وجان هـ. جنسن: التنبؤ التجريبي السريع جدًا و
تفسير قيم البروتين pKa، البروتينات، 2005، 61، 704-721.
WEB خدمة
يمكن استخدام PropKa عبر واجهة الويب على http://propka.ki.ku.dk/.
استخدم Propka عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
