هذا هو الأمر tqs الذي يمكن تشغيله في موفر الاستضافة المجاني OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
tqs - تسلسلات Solexa-Illumina عالية الجودة
موجز
تتم قراءة تسلسل solexa-Illumina عالي الجودة باستخدام عتبات محددة من قبل المستخدم.
OPTIONS
-h ، - مساعدة
إظهار رسالة المساعدة هذه والخروج
-f SEQFILE، --sequence file=SEQFILE
ملف تسلسل Illumina - تنسيق الإخراج من محلل الجينوم 1G (_seq.txt):
7 1 255 669
آكككككاكتكتاكاكاكككاتكاتككككتكجاك
-q QUALFILE, --qual file=QUALFILE
ملف prb يحتوي على كل شدة Illumina، كما تم إخراجها بواسطة 1G
محلل الجينوم (_prb.txt)
-ل مير، --طول = مير
يقرأ طول التسلسل (أي عدد دورات التسلسل، الافتراضي = 36)
-t العتبة، --العتبة = العتبة
قيمة عتبة الكثافة الأساسية (-40 إلى 40، الافتراضي=5)
-d DIFF، --الفرق=DIFF
فرق الشدة الأساسية بين الشدة الأعلى والثانية (من 1 إلى 80،
الافتراضي = 5)
-c CONSEC, --consec=CONSEC
الحد الأدنى لعدد القواعد المتتالية التي تتجاوز قيم العتبة (الافتراضي = 20)
-v ، - الإسراف
يعمل في وضع مطول.
استخدم tqs عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
