هذا هو الأمر wordfindere الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة على الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
الباحث عن الكلمات - يطابق التسلسلات الكبيرة مع واحد أو أكثر من التسلسلات الأخرى
موجز
الباحث عن الكلمات -تسلسل \ تدرج تسلسل -النتيجة seqall [-ملف البيانات المصفوفة] -جابوبن الطفو
-جابكستيند الطفو [-عرض عدد صحيح] [-ووردلين عدد صحيح] [-حدود عدد صحيح]
[- ليمتالين عدد صحيح] [- بطيئة عدد صحيح] [-Lowalign عدد صحيح] -ملف محاذاة
[-ملف خطأ ملف]
الباحث عن الكلمات -مساعدة
الوصف
الباحث عن الكلمات هو برنامج سطر أوامر من EMBOSS ("البيولوجيا الجزيئية الأوروبية المفتوحة
مجموعة برامج"). إنه جزء من مجموعة (مجموعات) القيادة "Alignment: Local".
OPTIONS
إدخال قسم
-تسلسل \ تدرج تسلسل
-النتيجة seqall
-ملف البيانات المصفوفة
هذا هو ملف مصفوفة التسجيل المستخدم عند مقارنة التسلسلات. افتراضيا هو
ملف 'EBLOSUM62' (للبروتينات) أو ملف 'EDNAFULL' (للتسلسلات النووية). هؤلاء
تم العثور على الملفات في دليل "البيانات" لتثبيت EMBOSS.
مطلوب: قسم
-جابوبن الطفو
القيمة الافتراضية: @ ($ (acdprotein)؟ 30.0: 30.0)
-جابكستيند الطفو
القيمة الافتراضية: @ ($ (acdprotein)؟ 1.5: 1.5)
إضافي قسم
-عرض عدد صحيح
القيمة الافتراضية: 16
-ووردلين عدد صحيح
القيمة الافتراضية: 6
-حدود عدد صحيح
- ليمتالين عدد صحيح
- بطيئة عدد صحيح
-Lowalign عدد صحيح
الناتج قسم
-ملف محاذاة
-ملف خطأ ملف
ملف الخطأ المراد كتابته إلى القيمة الافتراضية: wordfinder.error
استخدم wordfindere عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
