هذا هو تطبيق Linux المسمى AmPEP و AxPEP والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له كـ deep-ampep30-test_set.zip. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في مزود الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق المسمى AmPEP و AxPEP مع OnWorks عبر الإنترنت مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
لقطات الشاشة:
AmPEP و AxPEP
الوصف:
تعد الببتيدات المضادة للميكروبات (AMPs) من المرشحين الواعدين في مكافحة مسببات الأمراض المقاومة للأدوية المتعددة نظرًا لنطاقها الواسع من الأنشطة وسميتها المنخفضة. ومع ذلك ، فإن تحديد AMPs من خلال تجربة المعمل الرطب لا يزال مكلفًا ويستغرق وقتًا طويلاً. AmPEP هي طريقة حسابية دقيقة لتنبؤ AMP باستخدام خوارزمية الغابة العشوائية. يعتمد نموذج التنبؤ على أنماط توزيع خصائص الأحماض الأمينية على طول التسلسل. حقق نموذجنا الأمثل ، AmPEP مع نسبة بيانات 1: 3 دقة عالية جدًا بلغت 96٪ ، و MCC 0.9 ، و AUC-ROC من 0.99 ، وإحصاء Kappa 0.9. يتفوق AmPEP على الأساليب الحالية فيما يتعلق بالدقة و MCC و AUC-ROC عند اختباره باستخدام مجموعات البيانات المعيارية.المميزات
- كود مصدر MATLAB
- مجموعات بيانات AmPEP
- تعلم الآلة
- المعلوماتية الحيوية
- تسلسل الببتيد
- إكتشاف عقار
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/axpep/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.