هذا هو تطبيق Linux المسمى Digital Expression on the Web والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له باسم dew_RC2.tar.bz2. ويمكن تشغيله عبر الإنترنت في موفر الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق عبر الإنترنت المسمى Digital Expression on the Web باستخدام OnWorks مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
التعبير الرقمي على الويب
الوصف:
DEW عبارة عن منصة تتيح للمستخدمين استكشاف بيانات RNA-Seq. يتم تضمين واجهة مستخدم رسومية على شبكة الإنترنت.
يستمر التحليل على هذا النحو: يتم إجراء المحاذاة ذات الفجوات وتصحيحها من حيث الطول، وPCR وتحيز الأجزاء بحيث يتم تقدير جزء لكل كيلوباس (فعال) لكل مليون من القراءات (FPKM) بالإضافة إلى القراءات الأبسط لكل كيلو بايت لكل مليون من القراءات ( دورة في الدقيقة). عند توفيرها بأشكال إسوية متعددة وفي الوضع "السياقي"، تتضمن التصحيحات خوارزمية تعظيم التوقعات التي تقدر ملفات تعريف التعبير الفعالة ويتم إنتاج محاذاة مصححة. بالنسبة لكل جين يوفره المستخدم، يحسب DEW إحصائيات وصفية للتغطية (RPKM وFKMP والإجمالي والمتوسط والمتوسط)، وملفات تعريف التعبير (التي تم تطبيعها كـ R/FPKM ومتوسط تغيير الطية). يتيح DEW للمستخدمين استكشاف البيانات من خلال توفير الرسوم البيانية التفاعلية.
الجمهور
بحث علمي
واجهة المستخدم
على شبكة الإنترنت
لغة البرمجة
بيرل، جافا سكريبت، S/R
بيئة قاعدة البيانات
سكليتي
فئات
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/dew/. وقد تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمة التشغيل المجانية لدينا.