هذا هو تطبيق Linux المسمى HSRA والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له باسم HSRA-v1.1.tar.gz. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في موفر الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل هذا التطبيق المسمى HSRA وتشغيله عبر الإنترنت مجانًا مع OnWorks.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
HSRA
Ad
الوصف
HSRA هي أداة موازية تستند إلى MapReduce لرسم خرائط للقراءات من تجارب تسلسل الحمض النووي الريبي (RNA-seq). تبدأ تحليلات RNA-seq عادةً عن طريق تعيين القراءات إلى جينوم مرجعي لتحديد الموقع الذي نشأت منه القراءات ، وهي خطوة تستغرق وقتًا طويلاً للغاية. تسمح هذه الأداة للباحثين في مجال المعلوماتية الحيوية بتوزيع مهام الخرائط الخاصة بهم بكفاءة على عقد مجموعة من خلال الجمع بين محاذاة تقسم سريع متعدد الخيوط (HISAT2) مع Apache Hadoop ، وهو إطار حوسبة موزع لمعالجة البيانات الضخمة القابلة للتطوير.
تدعم HSRA حاليًا محاذاة القراءة أحادية النهاية ونهاية مقترنة من مجموعات بيانات FASTQ / FASTA. علاوة على ذلك ، تستخدم أداتنا مكتبة Hadoop Sequence Parser (HSP) (الرابط أعلاه) لقراءة مجموعات بيانات الإدخال المخزنة على نظام الملفات الموزعة Hadoop (HDFS) بكفاءة ، لتكون قادرة على معالجة مجموعات البيانات المضغوطة باستخدام برامج الترميز Gzip و BZip2.
الجمهور
تكنولوجيا المعلومات ، صناعة الرعاية الصحية ، العلوم / البحث
واجهة المستخدم
وحدة التحكم / المحطة الطرفية ، سطر الأوامر
لغة البرمجة
جافا
الأقسام
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/hsra/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.
