هذا هو تطبيق Linux المسمى kallisto والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له باسم kallisto_windows-v0.50.0.zip. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في موفر الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل هذا التطبيق المسمى kallisto وتشغيله عبر الإنترنت باستخدام OnWorks مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
SCREENSHOTS
Ad
كاليستو
الوصف
Kallisto هو برنامج للقياس الكمي شبه الأمثل لوفرة النسخ من بيانات RNA-Seq، أو بشكل عام للتسلسلات المستهدفة باستخدام قراءات التسلسل عالي الإنتاجية. وهو يعتمد على فكرة استخدام المحاذاة الزائفة لتحديد توافق القراءات والأهداف بسرعة، دون الحاجة إلى المحاذاة.
وفقًا للمعايير التي تم إجراؤها على كمبيوتر سطح مكتب Mac، يمكن لـ Kallisto تحديد 30 مليون قراءة RNA-seq بشرية في أقل من 3 دقائق باستخدام تسلسلات القراءة وفهرس النسخ، والذي يمكن أن يستغرق بناءه في حد ذاته أكثر من 10 دقائق. وبما أنه يستخدم المحاذاة الزائفة، فهو مقاوم للأخطاء في القراءات ويحافظ على المعلومات الأساسية اللازمة للقياس الكمي. وهذا يجعل كاليستو ليس سريعًا فحسب، بل ودقيقًا للغاية أيضًا. وفي العديد من المعايير، فإنه يتفوق بشكل كبير على الأدوات الموجودة.
المميزات
- يستخدم المحاذاة الزائفة
- سريع ودقيق
- يمكن تحليل الجزء الأكبر من RNA-Seq باستخدام المحقق
- يمكن استخدامه مع المقاعد للمعالجة المسبقة لبيانات RNA-seq أحادية الخلية
لغة البرمجة
C
الأقسام
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/kallisto.mirror/. وقد تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمة التشغيل المجانية لدينا.
