শিল্প - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

শিল্প - আর্টেমিস জিনোম ব্রাউজার এবং টীকা টুল

সাইনোপিসিস

শিল্প [অপশন] SEQUENCE_FILE [+FEATURE_FILE...]

বিকল্প

SEQUENCE_FILE একটি EMBL, GenBank, FASTA, বা GFF3 ফাইল
FEATURE_FILE একটি আর্টেমিস ট্যাব ফাইল, বা GFF ফাইল

- বিকল্প FILE FILE থেকে বিকল্পগুলির একটি পাঠ্য ফাইল পড়ুন৷
-debug পরিবর্তে ডিবাগিং JVM ব্যবহার করে চালান
-দ্রুত | -fast64 64/32 বিট সহ FastVM (hp Tru64 UNIX) ব্যবহার করুন
পয়েন্টার

-Dblack_belt_mode=? সতর্কতামূলক বার্তাগুলি সর্বনিম্ন রাখুন [সত্য, মিথ্যা]
-ডফসেট=XXX ভিউয়ার বেস পজিশনে খুলুন XXX [পূর্ণসংখ্যা >= 1]
-Duserplot=FILE[,FILE2] এক বা একাধিক ইউজারপ্লট খুলুন
-Dloguserplot=FILE[,FILE2] এক বা একাধিক ইউজারপ্লট খুলুন, লগ (ডেটা) নিন
-Dbam=FILE[,FILE2,...] এক বা একাধিক BAM, VCF বা BCF ফাইল খুলুন
-DbamClone=n একাধিক (n > 1) প্যানেলে সমস্ত BAM খুলুন
-Dbam[1,2,..]=FILE[,FILE2,..] আলাদা প্যানেলে BAM খুলুন
-Dshow_snps BamView এ SNP চিহ্ন দেখান
-Dshow_snp_plot BamView-এ SNP প্লট খুলুন
-Dshow_cov_plot BamView-এ কভারেজ প্লট খুলুন
-Dshow_forward_lines=? ফ্রেম লাইন লুকান/দেখান [সত্য, মিথ্যা]
-Dshow_reverse_lines=? বিপরীত ফ্রেম লাইন লুকান/দেখান [সত্য, মিথ্যা]
-Dchado="h:p/d?u" এই CHADO ডাটাবেস খুলতে আর্টেমিস পান
শুধুমাত্র ড্রেড-ওনলি CHADO ডাটাবেস ওপেন-ওনলি

উদাহরণ

% শিল্প AJ006275.embl
% art contigs.fa +annotation.gff +islands.tab
% শিল্প -Dblack_belt_mode=true -Dbam=ecoli_hiseq.bam E_coli_K12.gbk
% art -Duserplot=repeatmap.plot,geecee.plot Plasmid.gff3

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে আর্ট ব্যবহার করুন