এটি asn2ff কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
asn2ff - ASN.1 জৈবিক ডেটাকে ফ্ল্যাট ফরম্যাটে রূপান্তর করুন (পুরানো সংস্করণ)
সাইনোপিসিস
asn2ff [-] [-A X] [-B X] [-C] [-G] [-L F] [-M] [-R] [-V F] [-a ফাইলের নাম] [-b] [-d] [-e]
[-f b/p/e/s/x/z] [-g] [-h F] [-k F] [-l ফাইলের নাম] [-m r/d/s/c/k/l/e/p] [-n F]
[-o ফাইলের নাম] [-p F] [-q] [-r ফাইলের নাম] [-s] [-t] [-v F] [-w] [-y] [-z]
বর্ণনাঃ
asn2ff NCBI-এর ASN.1 ফরম্যাট থেকে জৈবিক ক্রমগুলির বর্ণনাকে যেকোন একটিতে রূপান্তরিত করে
বেশ কয়েকটি ফ্ল্যাট-ফাইল বিন্যাস। এই প্রোগ্রামটি একটি অবচিত ইন্টারফেসের চারপাশে নির্মিত; অনুগ্রহ
ব্যবহার asn2gb(1) পরিবর্তে.
বিকল্প
বিকল্পগুলির একটি সারাংশ নীচে অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছে।
- প্রিন্ট ব্যবহার বার্তা
-A X এ থেকে শুরু হওয়া অঞ্চল দেখান৷ X (ডিফল্ট হল 0)
-B X এ শেষ হওয়া অঞ্চল দেখান৷ X (ডিফল্ট শেষ অবস্থান)
-C Bankit মন্তব্য দেখান
-G আউটপুট শুধুমাত্র জিনোম ভিউতে একটি শীর্ষ বায়োসেক
-L F পুরানো (প্রি-জেনব্যাঙ্ক 127.0) LOCUS লাইন বিন্যাস ব্যবহার করুন
-M আউটপুট শুধুমাত্র মানচিত্র bioseqs
-R GenBank রিলিজের জন্য
-V F VERSION ব্যবহার করবেন না
-a ফাইলের নাম
ASN.1 ইনপুটের জন্য ফাইলের নাম (ডিফল্ট হল stdin)
-b বাইনারি মোডে asnfile ইনপুট করুন
-d SeqMgr ইন্ডেক্সিং ব্যবহার করুন
-e ইনপুট একটি Seq-এন্ট্রি
-f b/p/e/s/x/z
আউটপুট ফরমেট:
b GenBank (ডিফল্ট)
p GenPept
e EMBL
s PseudoEMBL
x GenBankSelect
z EMBLPPEPT
-g জিআই নম্বর দেখান
-h F ক্রম লুকান
-k F জটিল সেট ব্যবহার করবেন না (ফাই-সেট, মুট-সেট, পপ-সেট)
-l ফাইলের নাম
লগ ত্রুটি ফাইলের নাম
-m r/d/s/c/k/l/e/p
আউটপুট মোড:
আর রিলিজ (ডিফল্ট)
d ডাম্প
s সেকুইন
গ ক্রোমোস্কোপ
k dir-sub-debug
l dir-sub
e সংশোধন করা
p আংশিক রিপোর্ট
-n F কঠোর জিন_বাইন্ডিং
-o ফাইলের নাম
আউটপুট ফাইলের নাম (ডিফল্ট হল stdout)
-p F নতুন জিনের বৈশিষ্ট্য বাদ দিন
-q আউটপুট শুধুমাত্র একটি শীর্ষ bioseq
-r ফাইলের নাম
আউটপুট ত্রুটি লগফাইল (ডিফল্ট হল stderr)
-s ইনপুট একটি Seq-জমা
-t ভার্বোস মেসেজ টেক্সট দেখান
-v F ত্রুটি বার্তা দমন
-w HTML আউটপুট বিন্যাস ব্যবহার করুন
-y শুধুমাত্র প্রিন্ট সাহায্য বিন্যাস
-z সংগঠনের জন্য নতুন অ্যালগরিদম
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে asn2ff অনলাইন ব্যবহার করুন