bamtools - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

bamtools - BAM (জিনোম অ্যালাইনমেন্ট) ফাইলগুলি পরিচালনা করার জন্য টুলকিট

সাইনোপিসিস

বামটুল [--সহায়তা] কমান্ড [আরজিএস]

বর্ণনাঃ

BamTools BAM ফাইলগুলি ব্যবহার করে গবেষণা বিশ্লেষণ এবং ডেটা পরিচালনার সুবিধা দেয়। এটা সঙ্গে copes
বর্তমান সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি দ্বারা উত্পাদিত বিপুল পরিমাণ ডেটা যা সাধারণত
সংকুচিত, বাইনারি বিন্যাসে সংরক্ষিত যা পাঠ্য-ভিত্তিক পার্সারের দ্বারা সহজে পরিচালনা করা হয় না
সাধারণত বায়োইনফরমেটিক্স গবেষণায় ব্যবহৃত হয়।

বিকল্প

রূপান্তর
BAM এবং অন্যান্য ফরম্যাটের একটি সংখ্যার মধ্যে রূপান্তর করে

BAM ফাইল(গুলি) এ সারিবদ্ধকরণের সংখ্যা প্রিন্ট করুন

কভারেজ
ইনপুট BAM ফাইল থেকে কভারেজ পরিসংখ্যান প্রিন্ট করে

ব্যবহারকারী-নির্দিষ্ট মানদণ্ড দ্বারা ফিল্টার BAM ফাইল(গুলি) ফিল্টার করুন

হেডার BAM হেডার তথ্য প্রিন্ট করে

সূচী BAM ফাইলের জন্য সূচক তৈরি করে

মার্জ একাধিক BAM ফাইল একক ফাইলে মার্জ করুন

র্যান্ডম বিদ্যমান BAM ফাইল(গুলি) থেকে র্যান্ডম সারিবদ্ধকরণ নির্বাচন করুন, একটি পরীক্ষা হিসাবে আরও উদ্দেশ্য
টুল.

সমাধান
পেয়ারড-এন্ড রিডস সমাধান করে (প্রয়োজন হিসাবে IsProperPair পতাকা চিহ্নিত করা)

প্রত্যাবর্তন ডুপ্লিকেট চিহ্নগুলি সরিয়ে দেয় এবং মূল ভিত্তি গুণাবলী পুনরুদ্ধার করে

সর্ট কিছু মানদণ্ড অনুযায়ী BAM ফাইল সাজায়

split ব্যবহারকারী-নির্দিষ্ট সম্পত্তিতে একটি BAM ফাইল বিভক্ত করে, এর জন্য একটি নতুন BAM আউটপুট ফাইল তৈরি করে
প্রতিটি মান পাওয়া যায়

পরিসংখ্যান ইনপুট BAM ফাইল(গুলি) থেকে কিছু মৌলিক পরিসংখ্যান প্রিন্ট করে

একটি নির্দিষ্ট কমান্ড সম্পর্কে আরও তথ্যের জন্য 'bamtools help COMMAND' দেখুন।

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে bamtools ব্যবহার করুন