এটি হল ক্লিয়ারকাট কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
ক্লিয়ারকাট - রিলাক্সড নেবার জয়েনিং
সাইনোপিসিস
পরিষ্কার --in= --আউট= [অপশন] ...
বর্ণনাঃ
সাধারণ বিকল্পগুলি:
-h, --help
এই তথ্য প্রদর্শন করুন.
-V, --সংস্করণ
এই প্রোগ্রামের সংস্করণ প্রিন্ট করুন.
-v, -- ভারবোস
আরো আউটপুট. (ডিফল্ট: বন্ধ)
-q, -- শান্ত
নীরব অপারেশন। (ডিফল্ট: চালু)
-s, --বীজ=
স্পষ্টভাবে একটি নির্দিষ্ট মান PRNG বীজ সেট করুন।
-r, --এলোমেলো
প্রচেষ্টা নির্ধারকভাবে যোগদান করে। (ডিফল্ট: বন্ধ)
-S, --অদলবদল
এলোমেলোভাবে দূরত্ব ম্যাট্রিক্স এলোমেলো করুন। (ডিফল্ট: বন্ধ)
-N, --প্রতিবেশী
ঐতিহ্যগত প্রতিবেশী-যোগদানের অ্যালগরিদম ব্যবহার করুন। (ডিফল্ট: বন্ধ)
ইনপুট বিকল্পগুলি:
-I, --stdin
STDIN থেকে ইনপুট পড়ুন।
-d, --দূরত্ব
ইনপুট ফাইল একটি দূরত্ব ম্যাট্রিক্স। (ডিফল্ট: চালু)
-a, -- প্রান্তিককরণ
ইনপুট ফাইল হল সারিবদ্ধ ক্রমগুলির একটি সেট। (ডিফল্ট: বন্ধ)
-D, --ডিএনএ
ইনপুট প্রান্তিককরণ হল ডিএনএ সিকোয়েন্স।
-P, --প্রোটিন
ইনপুট প্রান্তিককরণ হল প্রোটিন ক্রম।
সংশোধন মডেল জন্য কম্পিউটিং DISTANCE এর ম্যাট্রিক্স (ডিফল্ট: কোন সংশোধন):
-j, --জুকস
দূরত্ব ম্যাট্রিক্স গণনার জন্য Jukes-Cantor সংশোধন ব্যবহার করুন।
-k, --কিমুরা
দূরত্ব ম্যাট্রিক্সের জন্য কিমুরা সংশোধন ব্যবহার করুন।
আউটপুট বিকল্পগুলি:
-O, --stdout
STDOUT-এ আউটপুট ট্রি।
-m, --ম্যাট্রিক্সআউট=নির্দিষ্ট ফাইলে আউটপুট দূরত্ব ম্যাট্রিক্স।
-n, --ntrees=
আউটপুট n গাছ. (ডিফল্ট: 1)
-e, -- ব্যাখ্যা করা
শাখার দৈর্ঘ্যের জন্য সূচকীয় স্বরলিপি। (ডিফল্ট: বন্ধ)
-E, --বিস্তারিত
দূরত্বের আউটপুটে সূচকীয় স্বরলিপি। (ডিফল্ট: বন্ধ)
উদাহরণ:
stdin এর মাধ্যমে দূরত্ব ম্যাট্রিক্স সরবরাহ করে গাছ গণনা করুন:
পরিষ্কার --দূরত্ব <দূরত্ব.txt> treefile.tre
একটি ফাইল থেকে ডিএনএ সিকোয়েন্সের একটি প্রান্তিককরণ সরবরাহ করে ট্রি গণনা করুন:
পরিষ্কার -- প্রান্তিককরণ --ডিএনএ --ভিতরে=শ্রেণীবিন্যাস.txt --আউট=গাছের ফাইল.tre
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইন ক্লিয়ারকাট ব্যবহার করুন
