এটি হল fastq-multx কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
fastq-multx - ea-utils: বারকোড ফাইলে বারকোড আইডি দিয়ে % প্রতিস্থাপন করুন
সাইনোপিসিস
fastq-multx [-g|-l|-B] -o r1.%.fq [mate.fq -o r2.%.fq]...
বর্ণনাঃ
fastq-multx: অবৈধ বিকল্প -- 'h' অজানা বিকল্প `-h'।
সংস্করণ: 1.02.684
আউটপুট ফাইলগুলিতে অবশ্যই একটি '%' চিহ্ন থাকতে হবে যা বারকোডগুলিতে বারকোড আইডি দিয়ে প্রতিস্থাপিত হয়
ফাইল সংশ্লিষ্ট ডেটা বাতিল করতে আউটপুট ফাইল n/a হতে পারে (বারকোডের জন্য এটি ব্যবহার করুন
পড়ুন)
বারকোড ফাইল (-B) এটা এমন দেখতে:
...
ডিফল্ট অনুমান করা হয় -বোল or -ইওল পরিষ্কার পরিসংখ্যানের উপর ভিত্তি করে।
If -g ব্যবহার করা হয়, তাহলে এর প্যারামিটারটি একটি সূচক লেন, এবং প্রায়শই ঘটতে থাকা ক্রমগুলি হল
ব্যবহার করা হয়েছে।
If -l ব্যবহার করা হয় তারপর ফাইলের সমস্ত বারকোড চেষ্টা করা হয় এবং *সর্বাধিক* সহ *গোষ্ঠী*
ম্যাচ নির্বাচন করা হয়।
দলবদ্ধ বারকোড ফাইল (-l or -L) এটা এমন দেখতে:
...
ম্যাটেড রিড, যদি সরবরাহ করা হয়, ইন-সিঙ্ক রাখা হয়
বিকল্প
-o FIL1 আউটপুট ফাইল (প্রতি ইনপুট একটি, প্রয়োজনীয়) -g SEQFIL থেকে বারকোড নির্ধারণ করুন
সূচী পড়া SEQFIL -l BCFIL একটি মাস্টার হিসাবে BCFIL ব্যবহার করে যেকোন রিড থেকে বারকোড নির্ধারণ করুন
তালিকা -L BCFIL থেকে বারকোড নির্ধারণ করুন , একটি মাস্টার তালিকা হিসাবে BCFIL ব্যবহার করে -B বিসিএফআইএল
নির্দিষ্ট ফাইল থেকে বারকোড ব্যবহার করুন, একটি সংকল্প পদক্ষেপ চালান না -b বল
বারকোড মিলের জন্য লাইনের শুরু (5') -e ব্যাটকোডের জন্য লাইনের শেষ (3') জোর করুন
ম্যাচিং -t গুণনীয়ক NUM (1), > 1 = আরও দ্বারা স্বয়ংক্রিয়-নির্ধারণের জন্য NUM ভাগ থ্রেশহোল্ড
সংবেদনশীল -G NAME শুধুমাত্র NAME এর সাথে মিলে যাওয়া গোষ্ঠী(গুলি) ব্যবহার করুন৷ -x বারকোড বন্ধ ট্রিম করবেন না
গন্তব্য লেখার আগে -n কার্যকর করবেন না, শুধু সম্ভাব্য বারকোড তালিকা প্রিন্ট করুন
-v C যাচাই করুন যে মিলিত আইডির C অক্ষরের সাথে মেলে (ইলুমিনার জন্য ' ' ব্যবহার করুন) -m N
N পর্যন্ত অমিলের অনুমতি দিন, যতক্ষণ না সেগুলি অনন্য (1) -d N একটি সর্বনিম্ন প্রয়োজন
সেরা এবং পরবর্তী সেরার মধ্যে N এর দূরত্ব (2) -q N একটি ন্যূনতম ফ্রেড প্রয়োজন
বারকোড বেস গ্রহণ করার জন্য N এর গুণমান (0)
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে fastq-multx ব্যবহার করুন
