āĻāĻāĻŋ āĻšāĻ˛ fpromlke āĻāĻŽāĻžāĻ¨ā§āĻĄ āĻ¯āĻž āĻāĻŽāĻžāĻĻā§āĻ° āĻāĻāĻžāĻ§āĻŋāĻ āĻŦāĻŋāĻ¨āĻžāĻŽā§āĻ˛ā§āĻ¯ā§āĻ° āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻāĻ¯āĻŧāĻžāĻ°ā§āĻāĻ¸ā§āĻā§āĻļāĻ¨ āĻ¯ā§āĻŽāĻ¨ āĻāĻŦā§āĻ¨ā§āĻā§ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨, āĻĢā§āĻĄā§āĻ°āĻž āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨, āĻāĻāĻ¨ā§āĻĄā§āĻ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻāĻŽā§āĻ˛ā§āĻāĻ° āĻŦāĻž MAC OS āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻāĻŽā§āĻ˛ā§āĻāĻ° āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°ā§ OnWorks āĻĢā§āĻ°āĻŋ āĻšā§āĻ¸ā§āĻāĻŋāĻ āĻĒā§āĻ°āĻĻāĻžāĻ¨āĻāĻžāĻ°ā§āĻ¤ā§ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§ āĻ¯ā§āĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§āĨ¤
āĻāĻžāĻ°ā§āĻ¯āĻā§āĻ°āĻŽ:
NAME āĻāĻ°
fpromlk - āĻ¸āĻ°ā§āĻŦāĻžāĻ§āĻŋāĻ āĻ¸āĻŽā§āĻāĻžāĻŦāĻ¨āĻž āĻĻā§āĻŦāĻžāĻ°āĻž āĻĒā§āĻ°ā§āĻāĻŋāĻ¨ phylogeny
āĻ¸āĻžāĻāĻ¨ā§āĻĒāĻŋāĻ¸āĻŋāĻ¸
fpromlk -āĻā§āĻ°āĻŽ seqsetall -āĻāĻ¨āĻā§āĻ°āĻŋāĻĢāĻŋāĻ˛ āĻŦā§āĻā§āĻˇ [-āĻŦāĻŋāĻāĻžāĻ āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖāĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻž] -āĻ°ā§āĻ āĻŦāĻŋāĻ¨ā§āĻ¯āĻžāĻ¸
- āĻŦāĻŋāĻāĻžāĻāĻ¸āĻŽā§āĻš āĻŦā§āĻļāĻŋāĻˇā§āĻā§āĻ¯ [-āĻāĻāĻ¨ āĻŦā§āĻļāĻŋāĻˇā§āĻā§āĻ¯] -āĻĻā§āĻ°ā§āĻā§āĻ¯ āĻŦā§āĻ˛āĻŋāĻ¯āĻŧāĻžāĻ¨ [-āĻŽāĻĄā§āĻ˛ āĻ¤āĻžāĻ˛āĻŋāĻāĻž]
[-āĻāĻžāĻŽāĻž āĻ¤āĻžāĻ˛āĻŋāĻāĻž] -āĻā§āĻ¯āĻžāĻŽāĻžāĻā§āĻāĻĢāĻŋāĻļāĻŋāĻ¯āĻŧā§āĻ¨ā§āĻ āĻāĻžāĻ¸āĻž -āĻāĻ¨āĻāĻžāĻŽā§āĻŽāĻžāĻā§āĻ¯āĻžāĻ āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖāĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻž - invarcoefficient āĻāĻžāĻ¸āĻž
-ninvarcat āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖāĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻž -āĻāĻ¨āĻāĻžāĻ°āĻĢā§āĻ°āĻžāĻ āĻāĻžāĻ¸āĻž -āĻāĻ¨āĻāĻāĻāĻāĻŽāĻāĻŽāĻŦāĻŋāĻāĻžāĻ āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖāĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻž -āĻšā§āĻŽāĻ°ā§āĻāĻ¸ āĻŦāĻŋāĻ¨ā§āĻ¯āĻžāĻ¸
-āĻšā§āĻŽ āĻ¸āĻŽā§āĻāĻžāĻŦāĻ¨āĻž āĻŦāĻŋāĻ¨ā§āĻ¯āĻžāĻ¸ - adjsite āĻŦā§āĻ˛āĻŋāĻ¯āĻŧāĻžāĻ¨ -āĻ˛āĻŽā§āĻŦāĻĻāĻž āĻāĻžāĻ¸āĻž - njumble āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖāĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻž
-āĻŦā§āĻ āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖāĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻž - āĻŦāĻŋāĻļā§āĻŦāĻŦā§āĻ¯āĻžāĻĒā§ āĻŦā§āĻ˛āĻŋāĻ¯āĻŧāĻžāĻ¨ [- outgrno āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖāĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻž] -āĻāĻāĻāĻĢāĻžāĻāĻ˛ āĻāĻāĻāĻĢāĻžāĻāĻ˛ [-āĻā§āĻ°āĻžāĻāĻ āĻāĻā§āĻ˛]
-āĻāĻāĻāĻā§āĻ°āĻŋāĻĢāĻžāĻāĻ˛ āĻāĻāĻāĻĢāĻžāĻāĻ˛ [-āĻĒā§āĻ°āĻŋāĻ¨ā§āĻāĻĄā§āĻāĻž āĻŦā§āĻ˛āĻŋāĻ¯āĻŧāĻžāĻ¨] [- āĻ āĻā§āĻ°āĻāĻ¤āĻŋ āĻŦā§āĻ˛āĻŋāĻ¯āĻŧāĻžāĻ¨] [- āĻāĻžāĻā§āĻ° āĻāĻžāĻĒ āĻŦā§āĻ˛āĻŋāĻ¯āĻŧāĻžāĻ¨]
[- āĻšāĻžāĻāĻĒāĻ¸ā§āĻā§āĻ āĻŦā§āĻ˛āĻŋāĻ¯āĻŧāĻžāĻ¨]
fpromlk -āĻšā§āĻ˛ā§āĻĒ
āĻŦāĻ°ā§āĻŖāĻ¨āĻžāĻ
fpromlk āĻāĻāĻŋ EMBOSS āĻāĻ° āĻāĻāĻāĻŋ āĻāĻŽāĻžāĻ¨ā§āĻĄ āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻĒā§āĻ°ā§āĻā§āĻ°āĻžāĻŽ ("āĻāĻāĻ°ā§āĻĒā§āĻ¯āĻŧ āĻāĻŖāĻŦāĻŋāĻ āĻā§āĻŦāĻŦāĻŋāĻā§āĻāĻžāĻ¨ āĻāĻĒā§āĻ¨
āĻ¸āĻĢāĻāĻāĻ¯āĻŧā§āĻ¯āĻžāĻ° āĻ¸ā§āĻ¯ā§āĻ"). āĻāĻāĻŋ "āĻĢāĻžāĻāĻ˛ā§āĻā§āĻ¨āĻŋ: āĻŽāĻ˛āĻŋāĻā§āĻ˛āĻžāĻ° āĻ¸āĻŋāĻā§āĻ¯āĻŧā§āĻ¨ā§āĻ¸" āĻāĻŽāĻžāĻ¨ā§āĻĄ āĻā§āĻ°ā§āĻĒ(āĻā§āĻ˛āĻŋ) āĻāĻ° āĻ āĻāĻļāĨ¤
āĻŦāĻŋāĻāĻ˛ā§āĻĒ
āĻāĻ¨āĻĒā§āĻ āĻ āĻ§ā§āĻ¯āĻžāĻ¯āĻŧ
-āĻā§āĻ°āĻŽ seqsetall
āĻāĻ āĻŦāĻž āĻāĻāĻžāĻ§āĻŋāĻ āĻā§āĻ°āĻŽ āĻĒā§āĻ°āĻžāĻ¨ā§āĻ¤āĻŋāĻāĻāĻ°āĻŖ āĻ§āĻžāĻ°āĻŖāĻāĻžāĻ°ā§ āĻĢāĻžāĻāĻ˛
-āĻāĻ¨āĻā§āĻ°āĻŋāĻĢāĻŋāĻ˛ āĻŦā§āĻā§āĻˇ
-āĻŦāĻŋāĻāĻžāĻ āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖāĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻž
āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ āĻŽāĻžāĻ¨: 1
-āĻ°ā§āĻ āĻŦāĻŋāĻ¨ā§āĻ¯āĻžāĻ¸
- āĻŦāĻŋāĻāĻžāĻāĻ¸āĻŽā§āĻš āĻŦā§āĻļāĻŋāĻˇā§āĻā§āĻ¯
-āĻāĻāĻ¨ āĻŦā§āĻļāĻŋāĻˇā§āĻā§āĻ¯
āĻ āĻ¤āĻŋāĻ°āĻŋāĻā§āĻ¤ āĻ āĻ§ā§āĻ¯āĻžāĻ¯āĻŧ
-āĻĻā§āĻ°ā§āĻā§āĻ¯ āĻŦā§āĻ˛āĻŋāĻ¯āĻŧāĻžāĻ¨
āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ āĻŽāĻžāĻ¨: N
-āĻŽāĻĄā§āĻ˛ āĻ¤āĻžāĻ˛āĻŋāĻāĻž
āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ āĻŽāĻžāĻ¨: āĻā§āĻ¨ā§āĻ¸-āĻā§āĻ˛āĻ°-āĻĨāĻ°ā§āĻ¨āĻāĻ¨
-āĻāĻžāĻŽāĻž āĻ¤āĻžāĻ˛āĻŋāĻāĻž
āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ āĻŽāĻžāĻ¨: n
-āĻā§āĻ¯āĻžāĻŽāĻžāĻā§āĻāĻĢāĻŋāĻļāĻŋāĻ¯āĻŧā§āĻ¨ā§āĻ āĻāĻžāĻ¸āĻž
āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ āĻŽāĻžāĻ¨: 1
-āĻāĻ¨āĻāĻžāĻŽā§āĻŽāĻžāĻā§āĻ¯āĻžāĻ āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖāĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻž
āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ āĻŽāĻžāĻ¨: 1
- invarcoefficient āĻāĻžāĻ¸āĻž
āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ āĻŽāĻžāĻ¨: 1
-ninvarcat āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖāĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻž
āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ āĻŽāĻžāĻ¨: 1
-āĻāĻ¨āĻāĻžāĻ°āĻĢā§āĻ°āĻžāĻ āĻāĻžāĻ¸āĻž
āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ āĻŽāĻžāĻ¨: 0.0
-āĻāĻ¨āĻāĻāĻāĻāĻŽāĻāĻŽāĻŦāĻŋāĻāĻžāĻ āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖāĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻž
āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ āĻŽāĻžāĻ¨: 1
-āĻšā§āĻŽāĻ°ā§āĻāĻ¸ āĻŦāĻŋāĻ¨ā§āĻ¯āĻžāĻ¸
āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ āĻŽāĻžāĻ¨: 1.0
-āĻšā§āĻŽ āĻ¸āĻŽā§āĻāĻžāĻŦāĻ¨āĻž āĻŦāĻŋāĻ¨ā§āĻ¯āĻžāĻ¸
āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ āĻŽāĻžāĻ¨: 1.0
- adjsite āĻŦā§āĻ˛āĻŋāĻ¯āĻŧāĻžāĻ¨
āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ āĻŽāĻžāĻ¨: N
-āĻ˛āĻŽā§āĻŦāĻĻāĻž āĻāĻžāĻ¸āĻž
āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ āĻŽāĻžāĻ¨: 1.0
- njumble āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖāĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻž
-āĻŦā§āĻ āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖāĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻž
āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ āĻŽāĻžāĻ¨: 1
- āĻŦāĻŋāĻļā§āĻŦāĻŦā§āĻ¯āĻžāĻĒā§ āĻŦā§āĻ˛āĻŋāĻ¯āĻŧāĻžāĻ¨
āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ āĻŽāĻžāĻ¨: N
- outgrno āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖāĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻž
āĻāĻāĻāĻĒā§āĻ āĻ āĻ§ā§āĻ¯āĻžāĻ¯āĻŧ
-āĻāĻāĻāĻĢāĻžāĻāĻ˛ āĻāĻāĻāĻĢāĻžāĻāĻ˛
-āĻā§āĻ°āĻžāĻāĻ āĻāĻā§āĻ˛
āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ āĻŽāĻžāĻ¨: Y
-āĻāĻāĻāĻā§āĻ°āĻŋāĻĢāĻžāĻāĻ˛ āĻāĻāĻāĻĢāĻžāĻāĻ˛
-āĻĒā§āĻ°āĻŋāĻ¨ā§āĻāĻĄā§āĻāĻž āĻŦā§āĻ˛āĻŋāĻ¯āĻŧāĻžāĻ¨
āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ āĻŽāĻžāĻ¨: N
- āĻ āĻā§āĻ°āĻāĻ¤āĻŋ āĻŦā§āĻ˛āĻŋāĻ¯āĻŧāĻžāĻ¨
āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ āĻŽāĻžāĻ¨: Y
- āĻāĻžāĻā§āĻ° āĻāĻžāĻĒ āĻŦā§āĻ˛āĻŋāĻ¯āĻŧāĻžāĻ¨
āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ āĻŽāĻžāĻ¨: Y
- āĻšāĻžāĻāĻĒāĻ¸ā§āĻā§āĻ āĻŦā§āĻ˛āĻŋāĻ¯āĻŧāĻžāĻ¨
āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ āĻŽāĻžāĻ¨: N
onworks.net āĻĒāĻ°āĻŋāĻˇā§āĻŦāĻž āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°ā§ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ā§ fpromlke āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°ā§āĻ¨
