এটি হল কমান্ড গেভাল যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
গেভাল - ট্রান্সক্রিপ্টের উপর ভিত্তি করে জিন মডেলের জন্য কভারেজ এবং ইন্টারগ্রিটি স্কোর গণনা করুন
প্রান্তিককরণ
সাইনোপিসিস
গেভাল [অপশন] alignments.gff3 genes.gff3 [moregenes.gff3 ...]
বর্ণনাঃ
মৌলিক বিকল্প:
-h|--- সাহায্য
এই সাহায্য বার্তাটি প্রিন্ট করুন এবং প্রস্থান করুন
-v|---সংস্করণ
প্রিন্ট সংস্করণ নম্বর এবং প্রস্থান করুন
অখণ্ডতা স্কোর গণনা করার জন্য ওজন (1.0 পর্যন্ত যোগ করতে হবে):
-a|---আলফা: ডাবল
ইন্ট্রোন নিশ্চিত করা হয়েছে, বা একক-এক্সন জিনের জন্য % প্রত্যাশিত সিডিএস দৈর্ঘ্য; ডিফল্ট হল 0.6
-b|--বিটা: ডাবল
এক্সন কভারেজ; ডিফল্ট হল 0.3
-g|--গামা: ডাবল
% প্রত্যাশিত 5' UTR দৈর্ঘ্য; ডিফল্ট হল 0.05
-e|--এপসিলন: ডাবল
% প্রত্যাশিত 3' UTR দৈর্ঘ্য; ডিফল্ট হল 0.05
অখণ্ডতা স্কোর গণনা করার জন্য প্রত্যাশিত বৈশিষ্ট্য দৈর্ঘ্য:
-c|--exp-cds: INT
প্রত্যাশিত সিডিএস দৈর্ঘ্য (বিপিতে); ডিফল্ট হল 400
-5|--exp-5putr: INT
প্রত্যাশিত 5' UTR দৈর্ঘ্য; ডিফল্ট হল 200
-3|--exp-3putr: INT
প্রত্যাশিত 3' UTR দৈর্ঘ্য; ডিফল্ট হল 100
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে গেভাল ব্যবহার করুন