এনসিএল কনভার্টার - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

NCLconverter - নেক্সাস ফাইলের বিষয়বস্তুর প্রতিবেদন

বর্ণনাঃ

NCLconverter একটি ফাইল রিড করে এবং একটি ফাইল প্রিফিক্সে বিষয়বস্তুর একটি প্রতিবেদন লেখে
(এর সাথে নির্দিষ্ট করা হয়েছে -o পতাকা) নির্বাচিত আউটপুট বিন্যাসে (এর সাথে নির্দিষ্ট করা হয়েছে -e পতাকা)।

সার্জারির সেতু সাধারণ ব্যবহার is কেবল:
NCL কনভার্টার

বিকল্প

-h কমান্ড লাইনে এই সাহায্য বার্তা দেখায়

-q ফাইল পড়ার সময় NCL স্ট্যাটাস বার্তা দমন করুন

-lএকটি ফাইল পড়ে এবং ফাইলের প্রতিটি লাইনকে নেক্সাস ফাইলের পথ হিসাবে বিবেচনা করে

-a আউটপুট AltNexus (গাছের মধ্যে কোন অনুবাদ টেবিল নেই)

-x ট্যাক্সা লেবেল হিসাবে গাছের অভ্যন্তরীণ লেবেলগুলিকে বৈধ করবেন না

-X গাছের সংখ্যাগুলিকে ট্যাক্সন সংখ্যা হিসাবে গণ্য করবেন না, তাদের স্বেচ্ছাচারী হিসাবে বিবেচনা করুন

লেবেল (NEXUS ফাইলের সাথে ব্যবহার করা উচিত নয়)।

-sনেক্সাস কঠোরতা স্তর নিয়ন্ত্রণ করে।

ডিফল্ট স্তরের সমতুল্য -s2 সঙ্গে প্রোগ্রাম আহ্বান -s3 বা একটি উচ্চতর
সংখ্যা কিছু সতর্কতাকে মারাত্মক ত্রুটিতে রূপান্তরিত করবে। সাথে চলছে -s1 কারণ হবে
পার্সার বিপজ্জনক গঠন গ্রহণ, এবং সঙ্গে চলমান -s0 কারণ হতে হবে
পার্সার ফাইলটি পার্সিং শেষ করার জন্য সর্বাত্মক প্রচেষ্টা করে (খুব গুরুতর সম্পর্কে সতর্কতা
ত্রুটি)।

উল্লেখ্য যে যখন -s0 কঠোরতা স্তর ব্যবহার করা হয়, এবং পার্সার শেষ করতে ব্যর্থ হয়, এটি
প্রায়শই তে রিপোর্ট করা ত্রুটির চেয়ে আগের ত্রুটির ফলাফল হবে৷
শেষ বার্তা.

-iতৈরি করতে ইন্টারলিভড পৃষ্ঠাগুলির দৈর্ঘ্য নির্দিষ্ট করে

-fপ্রত্যাশিত ইনপুট ফাইল বিন্যাস নির্দিষ্ট করে:

-fnexus
নেক্সাস (এটিও ডিফল্ট)

-ফাফাস্তা
ফাস্তায় অ্যামিনো অ্যাসিড ডেটা

-fdnafasta
ফাস্টে ডিএনএ ডেটা

-ফ্রনাফাস্তা
ফাস্টে আরএনএ ডেটা

ফরম্যাটের নামের সম্পূর্ণ তালিকা অনুসরণ করতে পারেন -f পতাকা হল:

নেক্সাস dnafasta aafasta rnafasta dnaphylip rnaphylip অ্যাফিলিপ ডিসক্রিটফিলিপ
dnaphylipinterleaved rnaphylipinterleaved aaphylipinterleaved
বিচ্ছিন্ন ফিলিপিন্টারলিভ ডিনারেল্যাক্সডফিলিপ rnarelaxedphylip অ্যারেলাক্সডফিলিপ
বিচ্ছিন্ন ফিলিপ ডিনারেল্যাক্সডফিলিপিন্টারলিভড
আরেলাক্সডফাইলিপিন্টারলিভড বিচ্ছিন্নভাবে রিলাক্সডফাইলিপিন্টারলিভড
ফিলিপট্রি রিলাক্সডফিলিপট্রি নেক্সএমএল ডিনাফিন আফিন আরনাফিন

-eপ্রত্যাশিত আউটপুট ফাইল বিন্যাস নির্দিষ্ট করে:

-এনেক্সাস
"স্বাভাবিক" নেক্সাস আউটপুট

-এফাস্তা
ফাস্টাতে অক্ষর ডেটা (একাধিক আউটপুট ফাইল হতে পারে)

- ইফিলিপ
ফিলিপে গাছ এবং চরিত্রের ডেটা (একাধিক আউটপুট ফাইল হতে পারে)

- এরেলাক্সডফিলিপ
শিথিল ফিলিপে গাছ এবং চরিত্রের ডেটা (একাধিক আউটপুট ফাইল হতে পারে)

-enexml
nexml আউটপুট (এটিও ডিফল্ট)

-oআউটপুট উপসর্গ নির্দিষ্ট করে।
একটি উপযুক্ত প্রত্যয় এবং এক্সটেনশন যোগ করা হয়

-dএকক আউটপুট গন্তব্য নির্দিষ্ট করে। অথবা ব্যবহার করতে পারেন -d- যে নির্দেশ করতে

আউটপুট স্ট্যান্ডার্ড আউটপুট নির্দেশিত করা উচিত. এই বিকল্প ব্যবহার সতর্কতা ফলাফল হতে পারে
তথ্যের পৃথক "ব্লক" সংযুক্ত করার কারণে একটি অবৈধ আউটপুটে
একটি একক ফাইল!

-u NEXUS ছাড়া অন্য ফরম্যাটে আন্ডারস্কোরকে স্পেসগুলিতে রূপান্তর করে।

-y"নিরাপদ" ট্যাক্সন নামগুলিতে অনুবাদ করুন এবং নতুন নামগুলিকে নেক্সাস হিসাবে সংরক্ষণ করুন৷

ফাইল কল ট্যাক্সা অ্যাসোসিয়েশন ব্লকের সাথে। প্রথম ট্যাক্স ব্লক
অ্যাসোসিয়েশন ব্লকটি মূল নামগুলি ধরে রাখবে এবং দ্বিতীয়টি "নিরাপদ" ধারণ করবে
নাম

-Yমত আচরণ করে -y, ছাড়া -Y একটি অনুবাদ ফাইল এমনকি উত্পাদিত হবে
যদি আসল নামগুলি ইতিমধ্যে "নিরাপদ" হত

-zনামক NEXUS-ফরম্যাট করা ফাইল ব্যবহার করুন ট্যাক্সা অ্যাসোসিয়েশন ব্লকের সাথে

আসল নাম পুনরুদ্ধার করতে।
ধরে নিলাম যে ট্যাক্সা অ্যাসোসিয়েশনের প্রথম ট্যাক্সা ব্লক

ব্লকটি আসল নাম ধারণ করে এবং দ্বিতীয়টি বর্তমান নাম। এই ফাংশন হয়
এর প্রভাব "পূর্বাবস্থায়" করার জন্য দরকারী -y বিকল্প।

-j একটি NameTranslationFile তৈরিকে দমন করুন

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে NCLconverter ব্যবহার করুন