pymvpa2-ofmotionqc - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

pymvpa2-ofmotionqc - একটি OpenFMRI ডেটাসেটের জন্য বোল্ড fMRI মোশন QC প্লট

সাইনোপিসিস

pymvpa2 ofmotionqc [--সংস্করণ] [-h] --পথ পাথ [-t ID] [--অনুমান-ফনাম NAME এর]
[--আত্মীয় REF REF] [-- বাদ-সাবজ ID [ID ...]] [--অনুমান-ক্রম লেবেলটি] [--rad2deg]
[--outlier-minthresh OUTLIER_MINTHRESH] [--outlier-stdthresh OUTLIER_STDTHRESH] [--সেভফিগ
সংরক্ষণ করুন]

বর্ণনাঃ

একটি OpenFMRI ডেটাসেট থেকে বোল্ড fMRI গতি অনুমানের জন্য একটি QC প্লট তৈরি করুন৷

উত্পন্ন চিত্র দুটি সাবপ্লট নিয়ে গঠিত: একটি অনুবাদের জন্য এবং একটি ঘূর্ণনের জন্য।
প্রতিটি গতি প্রকারের জন্য L2- আদর্শ প্লট করা হয়েছে। রানের সীমানা ড্যাশ দিয়ে নির্দেশিত হয়
উল্লম্ব লাইন। নিম্নলিখিত পরিসংখ্যান কল্পনা করা হয়

1. হালকা ধূসর ছায়াযুক্ত এলাকা সহ বিষয় জুড়ে বিস্তৃতি (মিনিট, সর্বোচ্চ)

2. একটি মাঝারি ধূসর ছায়াযুক্ত এলাকা সহ গড় চারপাশে 50% শতাংশ

3. গাঢ় ধূসর ছায়াযুক্ত এলাকা সহ গড় (SEM; +/-) এর স্ট্যান্ডার্ড ত্রুটি

4. একটি কালো রেখা সহ বিষয় জুড়ে মধ্যমা

5. বাইরের বিষয়গুলি পৃথক লাল রেখা হিসাবে উপস্থাপন করা হয়

আউটলায়ারদের এমন বিষয় হিসাবে সংজ্ঞায়িত করা হয় যেগুলি একটি নির্দিষ্ট দৌড়ের মধ্যে যে কোনও জায়গায় থ্রেশহোল্ড অতিক্রম করে৷ ভিতরে
সেক্ষেত্রে সেই রানের জন্য পুরো মোশন টাইম সিরিজটি একটি আউটলায়ার হিসাবে প্লট করা হয়েছে। জন্য আইডি
সনাক্ত করা আউটলায়ারগুলি কনসোলে মুদ্রিত হয়। মনে রাখবেন যে এই আইডিগুলির জন্য অ্যাকাউন্ট নেই
অনুপস্থিত ডেটা বা বাদ দেওয়া বিষয়। যাইহোক, কোন অনুপস্থিত তথ্য এবং কোন বর্জিত ক্ষেত্রে
সাংখ্যিক বিষয়ের আইডির সাথে তারা যে বিষয়গুলি সঙ্গতিপূর্ণ করে।

বিকল্প

--সংস্করণ
প্রোগ্রামের সংস্করণ এবং লাইসেন্সের তথ্য দেখান এবং প্রস্থান করুন

-h, --help, --help-np
এই সাহায্য বার্তাটি দেখান এবং প্রস্থান করুন। --help-np জোরপূর্বক একটি পেজার ব্যবহার নিষ্ক্রিয়
সাহায্য প্রদর্শনের জন্য।

--পথ পাথ
OpenFMRI ডেটাসেটের রুট ডিরেক্টরির পথ

-t আইডি, -- টাস্ক ID
QC প্লটের জন্য বোল্ড fMRI ডেটা সহ টাস্কের ID৷ ডিফল্ট: 1

--অনুমান-ফনাম NAME এর
প্রতিটি বোল্ড টাস্ক রান ফোল্ডারে গতি অনুমান সহ ফাইলগুলির নাম। ডিফল্ট:
bold_moest.txt

--আত্মীয় রেফ রেফ
রান Y-এ ভলিউম X-এর অনুমানের পার্থক্য হিসাবে সমস্ত অনুমান পুনঃকোড করুন
(--আত্মীয় YX)। সূচক শূন্য!

-- বাদ-সাবজ আমি করেছিলাম ...]
QC বিশ্লেষণ থেকে বাদ দেওয়ার জন্য স্থান-বিচ্ছিন্ন সুজেক্ট আইডিগুলির তালিকা

--অনুমান-ক্রম লেবেলটি
ফাইলে অনুমানের কলামের ক্রম। `ট্রান্সরোট` প্রথমে অনুবাদ নির্দেশ করে,
ঘূর্ণন দ্বারা অনুসরণ. `rottrans` বিপরীত ক্রম বোঝায়। ডিফল্ট: 'ট্রান্সরোট'

--rad2deg
নির্দিষ্ট করা হলে, ঘূর্ণন অনুমানগুলি রেডিয়ানে বলে ধরে নেওয়া হয় এবং রূপান্তরিত হবে
ডিগ্রী পর্যন্ত

--outlier-minthresh OUTLIER_MINTHRESH
আউটলিয়ার সনাক্তকরণের পরম সর্বনিম্ন থ্রেশহোল্ড। শুধুমাত্র এই এর চেয়ে বড় মান
থ্রেশহোল্ড কখনও একটি outlier হিসাবে বিবেচিত হবে. ডিফল্ট: কোনোটিই নয়

--outlier-stdthresh OUTLIER_STDTHRESH
বহির্মুখী সনাক্তকরণের জন্য স্ট্যান্ডার্ড বিচ্যুতির ইউনিটগুলিতে ন্যূনতম থ্রেশহোল্ড। ডিফল্ট:
না

--সেভফিগ সংরক্ষণ করুন
QC চিত্রের নিচে সংরক্ষণ করার জন্য ফাইলের নাম। ডিফল্ট: কোনোটিই নয়

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে pymvpa2-ofmotionqc ব্যবহার করুন