সুপারম্যাচের - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

সুপারম্যাচার - বৃহত্তর ক্রমগুলির আনুমানিক স্থানীয় জোড়া-ভিত্তিক প্রান্তিককরণ গণনা করুন

সাইনোপিসিস

সুপারম্যাচার -অনুযায়ী seqall -অনুক্রমে seqset [-তথ্য ফাইল matrixf] [-মিনস্কোর ভাসা]
-গপোপেন ভাসা - gapextend ভাসা [-প্রস্থ পূর্ণসংখ্যা] [-ওয়ার্ডলেন পূর্ণসংখ্যা]
-আউটফাইল শ্রেণীবদ্ধ করা [-ত্রুটি ফাইল আউটফাইল]

সুপারম্যাচার -হেল্প

বর্ণনাঃ

সুপারম্যাচার এটি EMBOSS এর একটি কমান্ড লাইন প্রোগ্রাম ("ইউরোপীয় আণবিক জীববিজ্ঞান ওপেন
সফটওয়্যার স্যুট"). এটি "সারিবদ্ধকরণ: স্থানীয়" কমান্ড গ্রুপ(গুলি) এর অংশ।

বিকল্প

ইনপুট অধ্যায়
-অনুযায়ী seqall

-অনুক্রমে seqset

-তথ্য ফাইল matrixf
এটি স্কোরিং ম্যাট্রিক্স ফাইল যা ক্রম তুলনা করার সময় ব্যবহৃত হয়। ডিফল্টরূপে এটি
ফাইল 'EBLOSUM62' (প্রোটিনের জন্য) অথবা ফাইল 'EDNAFULL' (নিউক্লিক সিকোয়েন্সের জন্য)। এইগুলো
ফাইলগুলি EMBOSS ইনস্টলেশনের 'ডেটা' ডিরেক্টরিতে পাওয়া যায়।

-মিনস্কোর ভাসা
একটি প্রান্তিককরণ রিপোর্ট করার জন্য ন্যূনতম প্রান্তিককরণ স্কোর।

প্রয়োজনীয় অধ্যায়
-গপোপেন ভাসা
ডিফল্ট মান: @($(acdprotein)? 10.0 : 10.0)

- gapextend ভাসা
ডিফল্ট মান: @($(acdprotein)? 0.5 : 0.5)

অতিরিক্ত অধ্যায়
-প্রস্থ পূর্ণসংখ্যা
ডিফল্ট মান: 16

-ওয়ার্ডলেন পূর্ণসংখ্যা
ডিফল্ট মান: 6

আউটপুট অধ্যায়
-আউটফাইল শ্রেণীবদ্ধ করা

-ত্রুটি ফাইল আউটফাইল
ব্যর্থ সারিবদ্ধকরণের জন্য ত্রুটি ফাইল লিখতে হবে ডিফল্ট মান: supermatcher.error

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে সুপারম্যাচার ব্যবহার করুন