এটি হল TMalign কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
TMalign - প্রোটিন গঠন প্রান্তিককরণ
সাইনোপিসিস
TMalign structure.pdbtarget.pdb[অপশন]
বর্ণনাঃ
TMalign প্রোটিনের একটি কাঠামোগত প্রান্তিককরণ সঞ্চালন করে। প্রান্তিককরণটি TM- দ্বারা স্কোর করা হয়
স্কোর অ্যালগরিদম।
বিকল্প
কোন বিকল্প ছাড়া শুরু হলে, কমান্ডের একটি সারাংশ দেওয়া হয়। দুটি প্রোটিন কাঠামো সহ
আর্গুমেন্ট হিসাবে উপস্থাপিত, TM-স্কোর দ্বিতীয় প্রোটিনের দৈর্ঘ্য ব্যবহার করে
স্বাভাবিক করা চূড়ান্ত কাঠামোগত প্রান্তিককরণ নীচের যে কোনও বিকল্পের সাথে অপরিবর্তনীয়।
-L সংখ্যা একটি নির্ধারিত দৈর্ঘ্য দ্বারা TM-স্কোরকে স্বাভাবিক করে (এএতে)
-a দুটি কাঠামোর গড় দৈর্ঘ্য দ্বারা TM-স্কোরকে স্বাভাবিক করে
-b দুটি কাঠামোর ছোটটির দৈর্ঘ্য দ্বারা TM-স্কোরকে স্বাভাবিক করে
-c দুটি কাঠামোর দীর্ঘ সময়ের দৈর্ঘ্য দ্বারা TM-স্কোরকে স্বাভাবিক করে
-o ফাইলের নাম টিএম-এলাইন চালান এবং সুপারপজিশনটিকে 'filename.sup' এ আউটপুট করুন এবং
'filename.sup_all'। আউটপুট ফাইলগুলি প্রোগ্রামের স্ক্রিপ্ট হিসাবে কাজ করে rasmol থেকে
সারিবদ্ধ অঞ্চল কলের উপরিস্থিত কাঠামো দেখুন
'rasmol -script TM.sup' সমস্ত অঞ্চলের উপরিস্থিত কাঠামো দেখতে
'rasmol -script TM.sup_all'।
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে TMalign ব্যবহার করুন
