tqs - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

tqs - ট্রিম কোয়ালিটি সোলেক্সা-ইলুমিনা সিকোয়েন্স

সাইনোপিসিস

কোয়ালিটি ট্রিম সোলেক্সা-ইলুমিনা সিকোয়েন্স ব্যবহারকারী-সংজ্ঞায়িত থ্রেশহোল্ড ব্যবহার করে রিড করে।

বিকল্প

-এইচ, --হেল্প
এই সাহায্য বার্তাটি দেখান এবং প্রস্থান করুন

-f SEQFILE, --sequence file=SEQFILE
ইলুমিনা সিকোয়েন্স ফাইল - 1G জিনোম বিশ্লেষক (_seq.txt) থেকে আউটপুট বিন্যাস:
7 1 255 669
AACCCCCACTCCTACAACGCCATCATTCCCCTCGAC

-q কোয়ালফাইল, --কোয়াল ফাইল = কোয়ালফাইল
1G দ্বারা আউটপুট হিসাবে সমস্ত Illumina তীব্রতা ধারণকারী একটি prb ফাইল
জিনোম বিশ্লেষক (_prb.txt)

-l MER, --length=MER
ক্রম পাঠের দৈর্ঘ্য (যেমন সিকোয়েন্সিং চক্রের সংখ্যা, ডিফল্ট = 36)

-t থ্রেশহোল্ড, --threshold=থ্রেশহোল্ড
বেস ইনটেনসিটি থ্রেশহোল্ড মান (-40 থেকে 40, ডিফল্ট=5)

-d DIFF, --difference=DIFF
শীর্ষ তীব্রতা এবং দ্বিতীয় সেরা (1 থেকে 80,) মধ্যে বেস তীব্রতার পার্থক্য
ডিফল্ট=5)

-c কনসেক, --consec=CONSEC
ন্যূনতম সংখ্যা ক্রমাগত বেস থ্রেশহোল্ড মান অতিক্রম করে (ডিফল্ট=20)

-v, --ভার্বোস
ভার্বোস মোডে চলে।

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে tqs ব্যবহার করুন