এটি BIRAP নামের লিনাক্স অ্যাপ যার সর্বশেষ প্রকাশ Sample_Files.zip হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
BIRAP নামের এই অ্যাপটি OnWorks সহ বিনামূল্যে অনলাইনে ডাউনলোড করুন এবং চালান।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
স্ক্রীনশটগুলি
Ad
বিরাপ
বর্ণনাঃ
BIRAP (ব্যাকটেরিয়াল ইন্টারজেনিক রিজিওন অ্যানালাইসিস পাইপলাইন) হল একটি ওপেন সোর্স, পার্ল পাইপলাইন ব্যবহার করা সহজ যা পরীক্ষামূলক ডেটা ব্যবহার করে ব্যাকটেরিয়াল জিনোমগুলিকে পুনরায় টীকা করতে ব্যবহার করা যেতে পারে। টুলটি RNA-seq এবং/অথবা প্রোটিওজেনোমিক্স থেকে প্রাপ্ত এক্সপ্রেশন প্রোফাইলকে একীভূত করে, এটিকে সিলিকো টীকাতে বিদ্যমান সাথে তুলনা করে এবং টীকা যাচাই করতে সাহায্য করে, প্রোটিন কোডিং অঞ্চলগুলিকে চিহ্নিত করতে, পুটেটিভ নন-কোডিং আরএনএ এবং সেইসাথে বিদ্যমান টীকাতে সঠিক ত্রুটিগুলিকে সাহায্য করে। . পাইপলাইনের জন্য SAMtools থেকে RNA-seq ডেটা এবং পেপটাইড/ePST লোকাস ফাইল (GFF) থেকে প্রোটিওজেনোমিক ম্যাপিং টুল থেকে জিনোমের সাথে প্রোট-ওজেনোমিক্স ডেটার জন্য "পাইলআপ" আউটপুট এবং সিলিকো টীকাতে বিদ্যমান। যখন জিনোমে (.coords ফরম্যাটে) প্রোমোটার্স এবং টার্মিনেটরের অবস্থান সম্পর্কিত তথ্য সরবরাহ করা হয়, তখন পাইপলাইনটি নন-কোডিং RNA সনাক্ত করতেও সহায়তা করবে।
বৈশিষ্ট্য
- ব্যাকটেরিয়া জিনোমের আন্তঃজেনিক অঞ্চল বিশ্লেষণ
- ব্যাকটেরিয়া জিনোম পুনরায় টীকা
- ছোট আরএনএ (sRNA) সনাক্তকরণ
- RNA-seq
- প্রোটিওজেনোমিক্স
পাঠকবর্গ
বিজ্ঞান/গবেষণা
ব্যবহারকারী ইন্টারফেস
কনসোল/টার্মিনাল, কমান্ড-লাইন
প্রোগ্রামিং ভাষা
পার্ল
বিভাগ
এটি একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/birap/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।
