এটি CIMS নামের লিনাক্স অ্যাপ যার সর্বশেষ প্রকাশ CIMS.v1.0.5.tgz হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
CIMS নামের এই অ্যাপটি বিনামূল্যে OnWorks সহ অনলাইনে ডাউনলোড করুন এবং চালান।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
স্ক্রীনশটগুলি
Ad
সিআইএমএস
বর্ণনাঃ
এই প্যাকেজটি HITS-CLIP ডেটা থেকে পরিসংখ্যানগতভাবে পুনরুত্পাদনযোগ্য ক্রসলিংকিং ইন্ডুসড মিউটেশন সাইট (CIMS) এবং ক্রস লিঙ্কিং ইনডিউসড ট্রাঙ্কেশন সাইট (CITS) সনাক্ত করার জন্য স্ক্রিপ্টগুলি অন্তর্ভুক্ত করে।
তথ্যসূত্র:
Moore, M.*, Zhang, C.*, Gantman, EC, Mele, A., Darnell, JC, Darnell, RB 2014. HITS-CLIP ব্যবহার করে একক-নিউক্লিওটাইড রেজোলিউশনে আরএনএর সাথে আর্গোনাউট এবং প্রচলিত আরএনএ-বাইন্ডিং প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া ম্যাপিং এবং CIMS বিশ্লেষণ। ন্যাট প্রোটোকল, 9:263-293।
Zhang,C.†, Darnell, RB† 2011. HITS-CLIP ডেটা থেকে একক-নিউক্লিওটাইড রেজোলিউশনে ভিভো প্রোটিন-আরএনএ মিথস্ক্রিয়ায় ম্যাপিং। নাট। জৈবপ্রযুক্তি. 29:607-614।
বৈশিষ্ট্য
- ম্যাপিং কাঁচা CLIP রেফারেন্স জিনোমে পড়া হয় (নভোলাইন ব্যবহার করে)
- এলোমেলো বারকোডের উপস্থিতির উপর নির্ভর করে বিভিন্ন মডেলের সাথে পিসিআর ডুপ্লিকেটগুলি ভেঙে ফেলা
- ক্লাস্টার CLIP ট্যাগগুলি ক্লাস্টার সনাক্ত করতে এবং সর্বোচ্চ উচ্চতা নির্ধারণ করতে
- অনন্য CLIP ট্যাগে ট্র্যাকিং মিউটেশন (সন্নিবেশ, মুছে ফেলা এবং প্রতিস্থাপন)
- মজবুত ক্রস লিঙ্কিং ইনডিউসড মিউটেশন সাইট (CIMS) সনাক্ত করা
- BrdU-CLIP, iCLIP বা অন্যান্য অনুরূপ বৈচিত্র থেকে শক্তিশালী ক্রস লিঙ্কিং ইনডিউসড ট্রাঙ্কেশন সাইট (CITS) সনাক্ত করা
পাঠকবর্গ
উন্নত শেষ ব্যবহারকারী
ব্যবহারকারী ইন্টারফেস
কমান্ড লাইন
প্রোগ্রামিং ভাষা
পার্ল
বিভাগ
এটি একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/ngs-cims/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।
