এটি ওয়েবে ডিজিটাল এক্সপ্রেশন নামে লিনাক্স অ্যাপ যার সর্বশেষ রিলিজটি dew_RC2.tar.bz2 হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
ডিজিটাল এক্সপ্রেশন নামের এই অ্যাপটি অনলাইনে ডাউনলোড করুন এবং চালান অনলাইনে OnWorks সহ বিনামূল্যে।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
ওয়েবে ডিজিটাল এক্সপ্রেশন
বর্ণনাঃ
DEW হল একটি প্ল্যাটফর্ম যা ব্যবহারকারীদের RNA-Seq ডেটা অন্বেষণ করতে দেয়। একটি ওয়েব-ভিত্তিক গ্রাফিক্যাল ইউজার ইন্টারফেস অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছে।
বিশ্লেষণটি এইভাবে এগিয়ে যায়: দৈর্ঘ্য, পিসিআর এবং ফ্র্যাগমেন্টের পক্ষপাতের জন্য ফাঁকযুক্ত প্রান্তিককরণগুলি সঞ্চালিত এবং সংশোধন করা হয় যাতে একটি ফ্র্যাগমেন্ট প্রতি (কার্যকর) কিলোবেস প্রতি মিলিয়ন রিডস (এফপিকেএম) অনুমান করা হয় এবং সেইসাথে সাধারণ রিডস প্রতি কেবি প্রতি মিলিয়ন রিডস ( RPKM)। যখন একাধিক আইসোফর্ম এবং 'প্রসঙ্গিক' মোডে প্রদান করা হয়, সংশোধনগুলির মধ্যে একটি প্রত্যাশার সর্বাধিকীকরণ অ্যালগরিদম কার্যকরী অভিব্যক্তি প্রোফাইল অনুমান করে এবং একটি সংশোধন করা প্রান্তিককরণ তৈরি করা হয়। ব্যবহারকারীর দেওয়া প্রতিটি জিনের জন্য, DEW কভারেজ বর্ণনামূলক পরিসংখ্যান গণনা করে (RPKM, FKMP এবং মোট, গড় এবং মধ্যম সংশোধন করা গণনা), অভিব্যক্তি প্রোফাইল (R/FPKM হিসাবে স্বাভাবিক এবং ভাঁজ পরিবর্তনের ছাঁটা গড়)। DEW ব্যবহারকারীদের ইন্টারেক্টিভ গ্রাফ প্রদান করে ডেটা অন্বেষণ করতে দেয়।
পাঠকবর্গ
বিজ্ঞান/গবেষণা
ব্যবহারকারী ইন্টারফেস
ওয়েব ভিত্তিক
প্রোগ্রামিং ভাষা
পার্ল, জাভাস্ক্রিপ্ট, এস/আর
ডাটাবেস পরিবেশ
SQLite
বিভাগ
এটি এমন একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/dew/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।