এটি HSRA নামের লিনাক্স অ্যাপ যার সর্বশেষ প্রকাশ HSRA-v1.1.tar.gz হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
HSRA নামের এই অ্যাপটি OnWorks-এর সাথে বিনামূল্যে অনলাইনে ডাউনলোড করুন এবং চালান।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
HSRA
Ad
বর্ণনাঃ
HSRA হল একটি MapReduce-ভিত্তিক সমান্তরাল টুল যা RNA সিকোয়েন্সিং (RNA-seq) পরীক্ষা থেকে ম্যাপিং রিডের জন্য। RNA-seq বিশ্লেষণগুলি সাধারণত রিডগুলিকে একটি রেফারেন্স জিনোমে ম্যাপ করার মাধ্যমে শুরু হয় যাতে রিডগুলি যে স্থান থেকে উদ্ভূত হয়েছিল তা নির্ধারণ করার জন্য, যা একটি খুব সময়সাপেক্ষ পদক্ষেপ। এই টুলটি বায়োইনফরমেটিক্স গবেষকদের একটি দ্রুত মাল্টিথ্রেডেড স্প্লিসড অ্যালাইনার (HISAT2) Apache Hadoop-এর সাথে একত্রিত করে একটি ক্লাস্টারের নোডের উপর তাদের ম্যাপিং কাজগুলিকে দক্ষতার সাথে বিতরণ করতে দেয়, যা স্কেলযোগ্য বিগ ডেটা প্রক্রিয়াকরণের জন্য একটি বিতরণ করা কম্পিউটিং কাঠামো।
HSRA বর্তমানে FASTQ/FASTA ডেটাসেট থেকে একক-এন্ড এবং পেয়ারড-এন্ড রিড অ্যালাইনমেন্ট সমর্থন করে। তাছাড়া, আমাদের টুল Hadoop সিকোয়েন্স পার্সার (HSP) লাইব্রেরি (উপরের লিঙ্ক) ব্যবহার করে Hadoop ডিস্ট্রিবিউটেড ফাইল সিস্টেম (HDFS) এ সঞ্চিত ইনপুট ডেটাসেটগুলিকে দক্ষতার সাথে পড়তে, Gzip এবং BZip2 কোডেকগুলির সাথে সংকুচিত ডেটাসেটগুলি প্রক্রিয়া করতে সক্ষম।
পাঠকবর্গ
তথ্য প্রযুক্তি, স্বাস্থ্যসেবা শিল্প, বিজ্ঞান/গবেষণা
ব্যবহারকারী ইন্টারফেস
কনসোল/টার্মিনাল, কমান্ড-লাইন
প্রোগ্রামিং ভাষা
জাভা
বিভাগ
এটি একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/hsra/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।
