āĻāĻāĻŋ MAGeCK āĻ¨āĻžāĻŽā§āĻ° āĻ˛āĻŋāĻ¨āĻžāĻā§āĻ¸ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻĒ āĻ¯āĻžāĻ° āĻ¸āĻ°ā§āĻŦāĻļā§āĻˇ āĻĒā§āĻ°āĻāĻžāĻļ broadgpp-brunello-library-corrected.txt.zip āĻšāĻŋāĻ¸āĻžāĻŦā§ āĻĄāĻžāĻāĻ¨āĻ˛ā§āĻĄ āĻāĻ°āĻž āĻ¯ā§āĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§āĨ¤ āĻāĻāĻŋ āĻāĻ¯āĻŧāĻžāĻ°ā§āĻāĻ¸ā§āĻā§āĻļāĻ¨ā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻŦāĻŋāĻ¨āĻžāĻŽā§āĻ˛ā§āĻ¯ā§āĻ° āĻšā§āĻ¸ā§āĻāĻŋāĻ āĻĒā§āĻ°āĻĻāĻžāĻ¨āĻāĻžāĻ°ā§ OnWorks-āĻ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ā§ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§ āĻ¯ā§āĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§āĨ¤
āĻŦāĻŋāĻ¨āĻžāĻŽā§āĻ˛ā§āĻ¯ā§āĻ° OnWorks-āĻāĻ° āĻ¸āĻžāĻĨā§ MAGECK āĻ¨āĻžāĻŽā§āĻ° āĻāĻ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻĒāĻāĻŋ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ā§ āĻĄāĻžāĻāĻ¨āĻ˛ā§āĻĄ āĻāĻ°ā§āĻ¨ āĻāĻŦāĻ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨āĨ¤
āĻāĻ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻĒāĻāĻŋ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻāĻ āĻ¨āĻŋāĻ°ā§āĻĻā§āĻļāĻžāĻŦāĻ˛ā§ āĻ āĻ¨ā§āĻ¸āĻ°āĻŖ āĻāĻ°ā§āĻ¨:
- 1. āĻāĻĒāĻ¨āĻžāĻ° āĻĒāĻŋāĻ¸āĻŋāĻ¤ā§ āĻāĻ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻĒā§āĻ˛āĻŋāĻā§āĻļāĻ¨āĻāĻŋ āĻĄāĻžāĻāĻ¨āĻ˛ā§āĻĄ āĻāĻ°ā§āĻ¨ā§ˇ
- 2. āĻāĻŽāĻžāĻĻā§āĻ° āĻĢāĻžāĻāĻ˛ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻ¨ā§āĻāĻžāĻ°ā§ āĻĒā§āĻ°āĻŦā§āĻļ āĻāĻ°ā§āĻ¨ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX āĻāĻĒāĻ¨āĻŋ āĻ¯ā§ āĻāĻāĻāĻžāĻ°āĻ¨ā§āĻŽ āĻāĻžāĻ¨āĨ¤
- 3. āĻāĻ āĻ§āĻ°āĻ¨ā§āĻ° āĻĢāĻžāĻāĻ˛ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻ¨ā§āĻāĻžāĻ°ā§ āĻāĻ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻĒā§āĻ˛āĻŋāĻā§āĻļāĻ¨āĻāĻŋ āĻāĻĒāĻ˛ā§āĻĄ āĻāĻ°ā§āĻ¨āĨ¤
- 4. āĻāĻ āĻāĻ¯āĻŧā§āĻŦāĻ¸āĻžāĻāĻ āĻĨā§āĻā§ OnWorks Linux āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻŦāĻž Windows āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻāĻŽā§āĻ˛ā§āĻāĻ° āĻŦāĻž MACOS āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻāĻŽā§āĻ˛ā§āĻāĻ° āĻļā§āĻ°ā§ āĻāĻ°ā§āĻ¨āĨ¤
- 5. OnWorks Linux OS āĻĨā§āĻā§ āĻāĻĒāĻ¨āĻŋ āĻāĻāĻŽāĻžāĻ¤ā§āĻ° āĻļā§āĻ°ā§ āĻāĻ°ā§āĻā§āĻ¨, āĻāĻŽāĻžāĻĻā§āĻ° āĻĢāĻžāĻāĻ˛ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻ¨ā§āĻāĻžāĻ°ā§ āĻ¯āĻžāĻ¨ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX āĻāĻĒāĻ¨āĻžāĻ° āĻĒāĻāĻ¨ā§āĻĻā§āĻ° āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ°āĻāĻžāĻ°ā§āĻ° āĻ¨āĻžāĻŽ āĻ¸āĻšāĨ¤
- 6. āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻĒā§āĻ˛āĻŋāĻā§āĻļāĻ¨āĻāĻŋ āĻĄāĻžāĻāĻ¨āĻ˛ā§āĻĄ āĻāĻ°ā§āĻ¨, āĻāĻāĻŋ āĻāĻ¨āĻ¸ā§āĻāĻ˛ āĻāĻ°ā§āĻ¨ āĻāĻŦāĻ āĻāĻāĻŋ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨āĨ¤
āĻ¸ā§āĻā§āĻ°ā§āĻ¨āĻļāĻāĻā§āĻ˛āĻŋ
Ad
MAGECK
āĻŦāĻ°ā§āĻŖāĻ¨āĻžāĻ
āĻāĻŋāĻ¨ā§āĻŽ-āĻāĻ¯āĻŧāĻžāĻāĻĄ CRISPR-Cas9 Knockout (MAGeCK) āĻāĻ° āĻŽāĻĄā§āĻ˛-āĻāĻŋāĻ¤ā§āĻ¤āĻŋāĻ āĻŦāĻŋāĻļā§āĻ˛ā§āĻˇāĻŖ āĻšāĻ˛ āĻ¸āĻžāĻŽā§āĻĒā§āĻ°āĻ¤āĻŋāĻ āĻāĻŋāĻ¨ā§āĻŽ-āĻ¸ā§āĻā§āĻ˛ CRISPR-Cas9 āĻ¨āĻāĻāĻāĻ āĻ¸ā§āĻā§āĻ°ā§āĻ¨ āĻĒā§āĻ°āĻ¯ā§āĻā§āĻ¤āĻŋ āĻĨā§āĻā§ āĻā§āĻ°ā§āĻ¤ā§āĻŦāĻĒā§āĻ°ā§āĻŖ āĻāĻŋāĻ¨āĻā§āĻ˛āĻŋ āĻ¸āĻ¨āĻžāĻā§āĻ¤ āĻāĻ°āĻžāĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻāĻāĻāĻŋ āĻāĻŖāĻ¨āĻžāĻŽā§āĻ˛āĻ āĻ¸āĻ°āĻā§āĻāĻžāĻŽāĨ¤
āĻ¨āĻŋāĻ°ā§āĻĻā§āĻļāĻžāĻŦāĻ˛ā§ āĻāĻŦāĻ āĻĄāĻā§āĻŽā§āĻ¨ā§āĻā§āĻļāĻ¨ā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯, āĻ
āĻ¨ā§āĻā§āĻ°āĻš āĻāĻ°ā§ āĻāĻāĻāĻŋ āĻĒāĻžāĻ¤āĻž āĻĻā§āĻā§āĻ¨āĨ¤
āĻĄāĻžāĻ¨āĻž-āĻĢāĻžāĻ°āĻŦāĻžāĻ° āĻā§āĻ¯āĻžāĻ¨āĻ¸āĻžāĻ° āĻāĻ¨āĻ¸ā§āĻāĻŋāĻāĻŋāĻāĻ/āĻšāĻžāĻ°ā§āĻāĻžāĻ°ā§āĻĄ āĻ¸ā§āĻā§āĻ˛ āĻ
āĻĢ āĻĒāĻžāĻŦāĻ˛āĻŋāĻ āĻšā§āĻ˛āĻĨā§āĻ° āĻĄāĻžāĻ āĻāĻŋāĻ¯āĻŧāĻžāĻāĻ˛ āĻļāĻžāĻ°ā§āĻ˛āĻŋ āĻ˛āĻŋāĻ-āĻāĻ° āĻ˛ā§āĻ¯āĻžāĻŦ āĻĨā§āĻā§ āĻāĻ¯āĻŧā§āĻ āĻ˛āĻŋ āĻāĻŦāĻ āĻšāĻžāĻ¨ āĻā§ āĻĻā§āĻŦāĻžāĻ°āĻž MAGECK āĻ¤ā§āĻ°āĻŋ āĻāĻ°āĻž āĻšāĻ¯āĻŧā§āĻā§ āĻāĻŦāĻ āĻāĻŋāĻ˛āĻĄā§āĻ°ā§āĻ¨āĻ¸ āĻ¨ā§āĻ¯āĻžāĻļāĻ¨āĻžāĻ˛ āĻŽā§āĻĄāĻŋāĻā§āĻ¯āĻžāĻ˛ āĻ¸ā§āĻ¨ā§āĻāĻžāĻ°ā§āĻ° āĻāĻ¯āĻŧā§āĻ āĻ˛āĻŋ āĻ˛ā§āĻ¯āĻžāĻŦ āĻĻā§āĻŦāĻžāĻ°āĻž āĻ°āĻā§āĻˇāĻŖāĻžāĻŦā§āĻā§āĻˇāĻŖ āĻāĻ°āĻž āĻšāĻ¯āĻŧā§āĻā§āĨ¤ āĻāĻŽāĻ°āĻž āĻā§āĻ˛āĻĄāĻŋāĻ¯āĻŧāĻž āĻ
ā§āĻ¯āĻžāĻĄāĻžāĻŽāĻ¸ āĻŦāĻžāĻ° āĻĒā§āĻ°ā§āĻā§āĻ°āĻžāĻŽ āĻāĻ¨ āĻāĻ¨ā§āĻā§āĻāĻŋāĻ āĻŦā§āĻ¸āĻŋāĻ āĻā§āĻ¯āĻžāĻ¨ā§āĻ¸āĻžāĻ° āĻ°āĻŋāĻ¸āĻžāĻ°ā§āĻ āĻāĻŦāĻ NIH/NHGRI āĻĨā§āĻā§ MAGECK āĻŦāĻŋāĻāĻžāĻļā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻ¸āĻšāĻžāĻ¯āĻŧāĻ¤āĻžāĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻ§āĻ¨ā§āĻ¯āĻŦāĻžāĻĻ āĻāĻžāĻ¨āĻžāĻāĨ¤
āĻŦā§āĻļāĻŋāĻˇā§āĻā§āĻ¯
- āĻ¸ā§āĻā§āĻ°ā§āĻ¨āĻŋāĻ āĻŦāĻŋāĻļā§āĻ˛ā§āĻˇāĻŖā§ āĻ¸āĻŦāĻā§āĻ¯āĻŧā§ āĻāĻ¨āĻĒā§āĻ°āĻŋāĻ¯āĻŧ āĻāĻŖāĻ¨āĻžāĻŽā§āĻ˛āĻ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻ˛āĻāĻ°āĻŋāĻĻāĻŽ
- 400 āĻāĻŋāĻ°āĻ āĻŦā§āĻļāĻŋ āĻāĻĻā§āĻ§ā§āĻ¤āĻŋ āĻāĻŦāĻ 60k āĻĄāĻžāĻāĻ¨āĻ˛ā§āĻĄ
- āĻāĻŋāĻ¨ā§āĻŽ-āĻāĻ¯āĻŧāĻžāĻāĻĄ CRISPR-Cas9 āĻ¨āĻāĻāĻāĻ āĻĒāĻ°ā§āĻā§āĻˇāĻžāĻ¯āĻŧ āĻāĻŋāĻ¨ āĻ¸ā§āĻā§āĻ°ā§āĻ¨ āĻāĻ°āĻžāĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻ¸āĻšāĻ, āĻ¸āĻšāĻā§ āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ°āĻ¯ā§āĻā§āĻ¯ āĻĒāĻžāĻāĻĒāĻ˛āĻžāĻāĻ¨
- āĻ¸āĻšāĻā§ āĻļā§āĻ°ā§ āĻāĻ°āĻžāĻ° āĻāĻŋāĻāĻā§āĻ°āĻŋāĻ¯āĻŧāĻžāĻ˛ āĻ¸āĻš āĻāĻāĻāĻŋ āĻ¸āĻŽā§āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖ āĻĄāĻā§āĻŽā§āĻ¨ā§āĻā§āĻļāĻ¨
- āĻāĻā§āĻ āĻ¸āĻāĻŦā§āĻĻāĻ¨āĻļā§āĻ˛āĻ¤āĻž āĻāĻŦāĻ āĻāĻŽ āĻŽāĻŋāĻĨā§āĻ¯āĻž āĻāĻŦāĻŋāĻˇā§āĻāĻžāĻ°ā§āĻ° āĻšāĻžāĻ°
- āĻ¨āĻ¤ā§āĻ¨ āĻŦā§āĻļāĻŋāĻˇā§āĻā§āĻ¯ āĻāĻŦāĻ āĻŦāĻžāĻ āĻĢāĻŋāĻā§āĻ¸ āĻ¸āĻš āĻ¸āĻā§āĻ°āĻŋāĻ¯āĻŧāĻāĻžāĻŦā§ āĻ¸ā§āĻ°ā§āĻ¸ āĻā§āĻĄ āĻŦāĻāĻžāĻ¯āĻŧ āĻ°āĻžāĻāĻž
- āĻŦāĻŋāĻāĻžāĻļāĻāĻžāĻ°ā§ āĻāĻŦāĻ āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ°āĻāĻžāĻ°ā§ āĻ¸āĻŽā§āĻĒā§āĻ°āĻĻāĻžāĻ¯āĻŧ āĻĨā§āĻā§ āĻ¸āĻŽāĻ°ā§āĻĨāĻ¨
- āĻāĻŋāĻā§āĻ¯ā§āĻ¯āĻŧāĻžāĻ˛āĻžāĻāĻā§āĻļāĻ¨ āĻŦā§āĻļāĻŋāĻˇā§āĻā§āĻ¯ā§āĻ° āĻāĻāĻāĻŋ āĻ¸ā§āĻ āĻ¯āĻž āĻĒā§āĻ°āĻāĻžāĻļāĻ¨āĻžāĻ° āĻŽāĻžāĻ¨āĻ āĻĒāĻ°āĻŋāĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻžāĻ¨ āĻ¤ā§āĻ°āĻŋ āĻāĻ°ā§
āĻĒāĻžāĻ āĻāĻŦāĻ°ā§āĻ
āĻŦāĻŋāĻā§āĻāĻžāĻ¨/āĻāĻŦā§āĻˇāĻŖāĻž
āĻĒā§āĻ°ā§āĻā§āĻ°āĻžāĻŽāĻŋāĻ āĻāĻžāĻˇāĻž
āĻĒāĻžāĻāĻĨāĻ¨, āĻ¸āĻŋ
āĻŦāĻŋāĻāĻžāĻ
āĻāĻāĻŋ āĻāĻŽāĻ¨ āĻāĻāĻāĻŋ āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻĒā§āĻ˛āĻŋāĻā§āĻļāĻ¨ āĻ¯āĻž https://sourceforge.net/projects/mageck/ āĻĨā§āĻā§āĻ āĻāĻ¨āĻž āĻ¯ā§āĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§āĨ¤ āĻāĻŽāĻžāĻĻā§āĻ° āĻŦāĻŋāĻ¨āĻžāĻŽā§āĻ˛ā§āĻ¯ā§āĻ° āĻ āĻĒāĻžāĻ°ā§āĻāĻŋāĻ āĻ¸āĻŋāĻ¸ā§āĻā§āĻŽāĻā§āĻ˛āĻŋāĻ° āĻŽāĻ§ā§āĻ¯ā§ āĻāĻāĻāĻŋ āĻĨā§āĻā§ āĻ¸āĻŦāĻā§āĻ¯āĻŧā§ āĻ¸āĻšāĻ āĻāĻĒāĻžāĻ¯āĻŧā§ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ā§ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻāĻāĻŋ OnWorks-āĻ āĻšā§āĻ¸ā§āĻ āĻāĻ°āĻž āĻšāĻ¯āĻŧā§āĻā§āĨ¤