এটি লিনাক্স অনলাইনে চালানোর জন্য সুইফট সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্ট প্রোগ্রাম নামে একটি লিনাক্স অ্যাপ যার সর্বশেষ প্রকাশটি swift-0.11.2.tgz হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
ডাউনলোড করুন এবং অনলাইনে চালান সুইফট সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্ট প্রোগ্রাম নামের এই অ্যাপটি লিনাক্সে অনলাইনে অনওয়ার্কস-এর সাথে বিনামূল্যে চালানোর জন্য।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
স্ক্রীনশটগুলি
Ad
লিনাক্সে অনলাইনে চালানোর জন্য সুইফট সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্ট প্রোগ্রাম
বর্ণনাঃ
সুইফট হল একটি ডিএনএ সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্ট প্রোগ্রাম যা স্মিথ-ওয়াটারম্যান অ্যালগরিদম ব্যবহার করে গ্যাপড অ্যালাইনমেন্ট তৈরি করে। এটি একটি ক্যোয়ারী ফাইল (FASTA ফর্ম্যাট) এবং একটি রেফারেন্স ফাইল (FASTA ফর্ম্যাট) ইনপুট হিসাবে নেয়৷ এটি রেফারেন্স নাম, পড়ার নাম, ফাঁকযুক্ত প্রান্তিককরণ, প্রান্তিককরণ স্কোর, প্রান্তিককরণের শুরু এবং শেষ অবস্থান এবং প্রান্তিককরণের দৈর্ঘ্য আউটপুট করে।আমি জিপিইউ টেকনোলজি কনফারেন্স 2012-এ সুইফটের উপর একটি বক্তৃতা দিয়েছিলাম। আলোচনাটি এখানে অ্যাক্সেস করা যেতে পারে http://www.gputechconf.com/gtcnew/on-demand-GTC.php?sessionTopic=58&searchByKeyword=&submit=&select=+&sessionEvent=&sessionYear=&sessionFormat=#1303.
সুইফট ইন্সটল ও চালাতে, অনুগ্রহ করে উইকি পৃষ্ঠা দেখুন: http://sourceforge.net/p/swiftseqaligner/wiki/Home/
আপনার যদি সুইফট ইনস্টল বা চালানোর জন্য আরও সাহায্যের প্রয়োজন হয়, অনুগ্রহ করে পঙ্কজ গুপ্তার সাথে যোগাযোগ করুন [ইমেল সুরক্ষিত].
বৈশিষ্ট্য
- স্মিথ-ওয়াটারম্যান অ্যালগরিদম ব্যবহার করে ফাঁকা প্রান্তিককরণ তৈরি করে
- স্মিথ-ওয়াটারম্যান অ্যালগরিদম GPU (গ্রাফিক্স প্রসেসিং ইউনিট) এ চলে
- একটি পঠিত ফাইল (FASTA বিন্যাস) এবং একটি রেফারেন্স ফাইল (FASTA বিন্যাস) ইনপুট হিসাবে গ্রহণ করে
- আউটপুট রেফারেন্স নাম, পড়ার নাম, ফাঁক সারিবদ্ধকরণ, প্রান্তিককরণ স্কোর, প্রান্তিককরণ শুরু এবং শেষ অবস্থান, এবং প্রান্তিককরণ দৈর্ঘ্য
- ইলুমিনা রিড সমর্থন করে (নির্দিষ্ট দৈর্ঘ্য)
- প্রয়োজনীয়তা: লিনাক্স ওএস; 4 জিবি সিস্টেম মেমরি; CUDA সক্ষম গ্রাফিক্স কার্ড; CUDA টুলকিট 4.2+; 6 জিবি গ্লোবাল মেমরি; 49 KB শেয়ার করা মেমরি
পাঠকবর্গ
বিজ্ঞান/গবেষণা
এটি একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/swiftseqaligner/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।
