āĻ‡āĻ‚āĻ°ā§‡āĻœāĻŋāĻĢāĻ°āĻžāĻ¸āĻŋāĻ¸ā§āĻĒā§āĻ¯āĻžāĻ¨āĻŋāĻļ

āĻ…āĻ¨āĻ“āĻ¯āĻŧāĻžāĻ°ā§āĻ•āĻ¸ āĻĢā§‡āĻ­āĻŋāĻ•āĻ¨

Windows āĻāĻ° āĻœāĻ¨ā§āĻ¯ GenomeRunner āĻĄāĻžāĻ‰āĻ¨āĻ˛ā§‹āĻĄ āĻ•āĻ°ā§āĻ¨

āĻ‰āĻŦā§āĻ¨ā§āĻŸā§ āĻ…āĻ¨āĻ˛āĻžāĻ‡āĻ¨, āĻĢā§‡āĻĄā§‹āĻ°āĻž āĻ…āĻ¨āĻ˛āĻžāĻ‡āĻ¨ āĻŦāĻž āĻĄā§‡āĻŦāĻŋāĻ¯āĻŧāĻžāĻ¨ āĻ…āĻ¨āĻ˛āĻžāĻ‡āĻ¨ā§‡ āĻ…āĻ¨āĻ˛āĻžāĻ‡āĻ¨ āĻ‰āĻ‡āĻ¨ āĻ‰āĻ‡āĻ¨ āĻšāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§‹āĻ° āĻœāĻ¨ā§āĻ¯ āĻŦāĻŋāĻ¨āĻžāĻŽā§‚āĻ˛ā§āĻ¯ā§‡ āĻœāĻŋāĻ¨ā§‹āĻŽāĻ°āĻžāĻ¨āĻžāĻ° āĻ‰āĻ‡āĻ¨ā§āĻĄā§‹āĻœ āĻ…ā§āĻ¯āĻžāĻĒ āĻĄāĻžāĻ‰āĻ¨āĻ˛ā§‹āĻĄ āĻ•āĻ°ā§āĻ¨

āĻāĻŸāĻŋ āĻšāĻ˛ GenomeRunner āĻ¨āĻžāĻŽā§‡āĻ° āĻ‰āĻ‡āĻ¨ā§āĻĄā§‹āĻœ āĻ…ā§āĻ¯āĻžāĻĒ āĻ¯āĻžāĻ° āĻ¸āĻ°ā§āĻŦāĻļā§‡āĻˇ āĻ°āĻŋāĻ˛āĻŋāĻœāĻŸāĻŋ GenomeRunner-v4.0-Setup.zip āĻšāĻŋāĻ¸āĻžāĻŦā§‡ āĻĄāĻžāĻ‰āĻ¨āĻ˛ā§‹āĻĄ āĻ•āĻ°āĻž āĻ¯ā§‡āĻ¤ā§‡ āĻĒāĻžāĻ°ā§‡āĨ¤ āĻāĻŸāĻŋ āĻ“āĻ¯āĻŧāĻžāĻ°ā§āĻ•āĻ¸ā§āĻŸā§‡āĻļāĻ¨ā§‡āĻ° āĻœāĻ¨ā§āĻ¯ āĻŦāĻŋāĻ¨āĻžāĻŽā§‚āĻ˛ā§āĻ¯ā§‡āĻ° āĻšā§‹āĻ¸ā§āĻŸāĻŋāĻ‚ āĻĒā§āĻ°āĻĻāĻžāĻ¨āĻ•āĻžāĻ°ā§€ OnWorks-āĻ āĻ…āĻ¨āĻ˛āĻžāĻ‡āĻ¨ā§‡ āĻšāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§‹ āĻ¯ā§‡āĻ¤ā§‡ āĻĒāĻžāĻ°ā§‡āĨ¤

āĻ…āĻ¨āĻ˛āĻžāĻ‡āĻ¨ā§‡ āĻĄāĻžāĻ‰āĻ¨āĻ˛ā§‹āĻĄ āĻ•āĻ°ā§āĻ¨ āĻāĻŦāĻ‚ āĻšāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ GenomeRunner āĻ¨āĻžāĻŽā§‡āĻ° āĻāĻ‡ āĻ…ā§āĻ¯āĻžāĻĒāĻŸāĻŋ OnWorks āĻ¸āĻš āĻŦāĻŋāĻ¨āĻžāĻŽā§‚āĻ˛ā§āĻ¯ā§‡āĨ¤

āĻāĻ‡ āĻ…ā§āĻ¯āĻžāĻĒāĻŸāĻŋ āĻšāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§‹āĻ° āĻœāĻ¨ā§āĻ¯ āĻāĻ‡ āĻ¨āĻŋāĻ°ā§āĻĻā§‡āĻļāĻžāĻŦāĻ˛ā§€ āĻ…āĻ¨ā§āĻ¸āĻ°āĻŖ āĻ•āĻ°ā§āĻ¨:

- 1. āĻ†āĻĒāĻ¨āĻžāĻ° āĻĒāĻŋāĻ¸āĻŋāĻ¤ā§‡ āĻāĻ‡ āĻ…ā§āĻ¯āĻžāĻĒā§āĻ˛āĻŋāĻ•ā§‡āĻļāĻ¨āĻŸāĻŋ āĻĄāĻžāĻ‰āĻ¨āĻ˛ā§‹āĻĄ āĻ•āĻ°ā§āĻ¨ā§ˇ

- 2. āĻ†āĻŽāĻžāĻĻā§‡āĻ° āĻĢāĻžāĻ‡āĻ˛ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻ¨ā§‡āĻœāĻžāĻ°ā§‡ āĻĒā§āĻ°āĻŦā§‡āĻļ āĻ•āĻ°ā§āĻ¨ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX āĻ†āĻĒāĻ¨āĻŋ āĻ¯ā§‡ āĻ‡āĻ‰āĻœāĻžāĻ°āĻ¨ā§‡āĻŽ āĻšāĻžāĻ¨āĨ¤

- 3. āĻāĻ‡ āĻ§āĻ°āĻ¨ā§‡āĻ° āĻĢāĻžāĻ‡āĻ˛ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻ¨ā§‡āĻœāĻžāĻ°ā§‡ āĻāĻ‡ āĻ…ā§āĻ¯āĻžāĻĒā§āĻ˛āĻŋāĻ•ā§‡āĻļāĻ¨āĻŸāĻŋ āĻ†āĻĒāĻ˛ā§‹āĻĄ āĻ•āĻ°ā§āĻ¨āĨ¤

- 4. āĻāĻ‡ āĻ“āĻ¯āĻŧā§‡āĻŦāĻ¸āĻžāĻ‡āĻŸ āĻĨā§‡āĻ•ā§‡ āĻ¯ā§‡āĻ•ā§‹āĻ¨ā§‹ OS OnWorks āĻ…āĻ¨āĻ˛āĻžāĻ‡āĻ¨ āĻāĻŽā§āĻ˛ā§‡āĻŸāĻ° āĻļā§āĻ°ā§ āĻ•āĻ°ā§āĻ¨, āĻ¤āĻŦā§‡ āĻ†āĻ°āĻ“ āĻ­āĻžāĻ˛ā§‹ āĻ‰āĻ‡āĻ¨ā§āĻĄā§‹āĻœ āĻ…āĻ¨āĻ˛āĻžāĻ‡āĻ¨ āĻāĻŽā§āĻ˛ā§‡āĻŸāĻ°āĨ¤

- 5. OnWorks Windows OS āĻĨā§‡āĻ•ā§‡ āĻ†āĻĒāĻ¨āĻŋ āĻāĻ‡āĻŽāĻžāĻ¤ā§āĻ° āĻļā§āĻ°ā§ āĻ•āĻ°ā§‡āĻ›ā§‡āĻ¨, āĻ†āĻŽāĻžāĻĻā§‡āĻ° āĻĢāĻžāĻ‡āĻ˛ āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻ¨ā§‡āĻœāĻžāĻ°ā§‡ āĻ¯āĻžāĻ¨ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX āĻ†āĻĒāĻ¨āĻžāĻ° āĻĒāĻ›āĻ¨ā§āĻĻā§‡āĻ° āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ°āĻ•āĻžāĻ°ā§€āĻ° āĻ¨āĻžāĻŽ āĻ¸āĻšāĨ¤

- 6. āĻ…ā§āĻ¯āĻžāĻĒā§āĻ˛āĻŋāĻ•ā§‡āĻļāĻ¨āĻŸāĻŋ āĻĄāĻžāĻ‰āĻ¨āĻ˛ā§‹āĻĄ āĻ•āĻ°ā§āĻ¨ āĻāĻŦāĻ‚ āĻāĻŸāĻŋ āĻ‡āĻ¨āĻ¸ā§āĻŸāĻ˛ āĻ•āĻ°ā§āĻ¨āĨ¤

- 7. āĻ†āĻĒāĻ¨āĻžāĻ° āĻ˛āĻŋāĻ¨āĻžāĻ•ā§āĻ¸ āĻĄāĻŋāĻ¸ā§āĻŸā§āĻ°āĻŋāĻŦāĻŋāĻ‰āĻļāĻ¨ āĻ¸āĻĢā§āĻŸāĻ“āĻ¯āĻŧā§āĻ¯āĻžāĻ° āĻ¸āĻ‚āĻ—ā§āĻ°āĻšāĻ¸ā§āĻĨāĻ˛ āĻĨā§‡āĻ•ā§‡ āĻ“āĻ¯āĻŧāĻžāĻ‡āĻ¨ āĻĄāĻžāĻ‰āĻ¨āĻ˛ā§‹āĻĄ āĻ•āĻ°ā§āĻ¨āĨ¤ āĻāĻ•āĻŦāĻžāĻ° āĻ‡āĻ¨āĻ¸ā§āĻŸāĻ˛ āĻšāĻ¯āĻŧā§‡ āĻ—ā§‡āĻ˛ā§‡, āĻ†āĻĒāĻ¨āĻŋ āĻ“āĻ¯āĻŧāĻžāĻ‡āĻ¨ āĻĻāĻŋāĻ¯āĻŧā§‡ āĻšāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§‹āĻ° āĻœāĻ¨ā§āĻ¯ āĻ…ā§āĻ¯āĻžāĻĒāĻŸāĻŋāĻ¤ā§‡ āĻĄāĻžāĻŦāĻ˛-āĻ•ā§āĻ˛āĻŋāĻ• āĻ•āĻ°āĻ¤ā§‡ āĻĒāĻžāĻ°ā§‡āĻ¨āĨ¤ āĻāĻ›āĻžāĻĄāĻŧāĻžāĻ“ āĻ†āĻĒāĻ¨āĻŋ PlayOnLinux āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻ•āĻ°ā§‡ āĻĻā§‡āĻ–āĻ¤ā§‡ āĻĒāĻžāĻ°ā§‡āĻ¨, āĻ“āĻ¯āĻŧāĻžāĻ‡āĻ¨ā§‡āĻ° āĻ‰āĻĒāĻ° āĻāĻ•āĻŸāĻŋ āĻ…āĻ­āĻŋāĻ¨āĻŦ āĻ‡āĻ¨ā§āĻŸāĻžāĻ°āĻĢā§‡āĻ¸ āĻ¯āĻž āĻ†āĻĒāĻ¨āĻžāĻ•ā§‡ āĻœāĻ¨āĻĒā§āĻ°āĻŋāĻ¯āĻŧ āĻ‰āĻ‡āĻ¨ā§āĻĄā§‹āĻœ āĻĒā§āĻ°ā§‹āĻ—ā§āĻ°āĻžāĻŽ āĻāĻŦāĻ‚ āĻ—ā§‡āĻŽ āĻ‡āĻ¨āĻ¸ā§āĻŸāĻ˛ āĻ•āĻ°āĻ¤ā§‡ āĻ¸āĻžāĻšāĻžāĻ¯ā§āĻ¯ āĻ•āĻ°āĻŦā§‡āĨ¤

āĻ“āĻ¯āĻŧāĻžāĻ‡āĻ¨ āĻ˛āĻŋāĻ¨āĻžāĻ•ā§āĻ¸ā§‡ āĻ‰āĻ‡āĻ¨ā§āĻĄā§‹āĻœ āĻ¸āĻĢā§āĻŸāĻ“āĻ¯āĻŧā§āĻ¯āĻžāĻ° āĻšāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§‹āĻ° āĻāĻ•āĻŸāĻŋ āĻ‰āĻĒāĻžāĻ¯āĻŧ, āĻ•āĻŋāĻ¨ā§āĻ¤ā§ āĻ•ā§‹āĻ¨ āĻ‰āĻ‡āĻ¨ā§āĻĄā§‹āĻœ āĻĒā§āĻ°āĻ¯āĻŧā§‹āĻœāĻ¨ āĻ¨ā§‡āĻ‡āĨ¤ āĻ“āĻ¯āĻŧāĻžāĻ‡āĻ¨ āĻšāĻ˛ āĻāĻ•āĻŸāĻŋ āĻ“āĻĒā§‡āĻ¨ āĻ¸ā§‹āĻ°ā§āĻ¸ āĻ‰āĻ‡āĻ¨ā§āĻĄā§‹āĻœ āĻ¸āĻžāĻŽāĻžā§āĻœāĻ¸ā§āĻ¯āĻĒā§‚āĻ°ā§āĻŖ āĻ¸ā§āĻ¤āĻ° āĻ¯āĻž āĻ¸āĻ°āĻžāĻ¸āĻ°āĻŋ āĻ¯ā§‡āĻ•ā§‹āĻ¨ā§‹ āĻ˛āĻŋāĻ¨āĻžāĻ•ā§āĻ¸ āĻĄā§‡āĻ¸ā§āĻ•āĻŸāĻĒā§‡ āĻ‰āĻ‡āĻ¨ā§āĻĄā§‹āĻœ āĻĒā§āĻ°ā§‹āĻ—ā§āĻ°āĻžāĻŽ āĻšāĻžāĻ˛āĻžāĻ¤ā§‡ āĻĒāĻžāĻ°ā§‡āĨ¤ āĻŽā§‚āĻ˛āĻ¤, āĻ“āĻ¯āĻŧāĻžāĻ‡āĻ¨ āĻ¸ā§āĻ•ā§āĻ°ā§āĻ¯āĻžāĻš āĻĨā§‡āĻ•ā§‡ āĻĒāĻ°ā§āĻ¯āĻžāĻĒā§āĻ¤ āĻ‰āĻ‡āĻ¨ā§āĻĄā§‹āĻœ āĻĒā§āĻ¨āĻ°āĻžāĻ¯āĻŧ āĻĒā§āĻ°āĻ¯āĻŧā§‹āĻ— āĻ•āĻ°āĻžāĻ° āĻšā§‡āĻˇā§āĻŸāĻž āĻ•āĻ°āĻ›ā§‡ āĻ¯āĻžāĻ¤ā§‡ āĻāĻŸāĻŋ āĻ†āĻ¸āĻ˛ā§‡ āĻ‰āĻ‡āĻ¨ā§āĻĄā§‹āĻœā§‡āĻ° āĻĒā§āĻ°āĻ¯āĻŧā§‹āĻœāĻ¨ āĻ›āĻžāĻĄāĻŧāĻžāĻ‡ āĻ¸ā§‡āĻ‡ āĻ¸āĻŽāĻ¸ā§āĻ¤ āĻ‰āĻ‡āĻ¨ā§āĻĄā§‹āĻœ āĻ…ā§āĻ¯āĻžāĻĒā§āĻ˛āĻŋāĻ•ā§‡āĻļāĻ¨ āĻšāĻžāĻ˛āĻžāĻ¤ā§‡ āĻĒāĻžāĻ°ā§‡āĨ¤

āĻ¸ā§āĻ•ā§āĻ°ā§€āĻ¨āĻļāĻŸāĻ—ā§āĻ˛āĻŋ

Ad


āĻœāĻŋāĻ¨ā§‹āĻŽ āĻ°āĻžāĻ¨āĻžāĻ°


āĻŦāĻ°ā§āĻŖāĻ¨āĻžāĻƒ

āĻĻā§āĻ°āĻˇā§āĻŸāĻŦā§āĻ¯: āĻāĻ‡ āĻ¸āĻ‚āĻ¸ā§āĻ•āĻ°āĻŖā§‡ āĻ…āĻ¤āĻŋāĻ°āĻŋāĻ•ā§āĻ¤ SQLite āĻĄāĻžāĻŸāĻžāĻŦā§‡āĻ¸ āĻĢāĻžāĻ‡āĻ˛ āĻĒā§āĻ°āĻ¯āĻŧā§‹āĻœāĻ¨āĨ¤ āĻ¸ā§‡āĻ—ā§āĻ˛āĻŋ āĻĒā§‡āĻ¤ā§‡ āĻŦāĻŋāĻ•āĻžāĻļāĻ•āĻžāĻ°ā§€āĻĻā§‡āĻ° āĻ¸āĻžāĻĨā§‡ āĻ¯ā§‹āĻ—āĻžāĻ¯ā§‹āĻ— āĻ•āĻ°ā§āĻ¨āĨ¤

āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° http://www.integrativegenomics.org/ āĻ¸āĻ°ā§āĻŦāĻļā§‡āĻˇ āĻ¤āĻĨā§āĻ¯ āĻāĻŦāĻ‚ āĻŦāĻŋāĻļā§āĻ˛ā§‡āĻˇāĻŖā§‡āĻ° āĻœāĻ¨ā§āĻ¯āĨ¤

GenomeRunner āĻšāĻ˛ āĻœāĻŋāĻ¨ā§‹āĻŽ āĻ…āĻ¨ā§āĻŦā§‡āĻˇāĻŖ āĻ¸ā§āĻŦāĻ¯āĻŧāĻ‚āĻ•ā§āĻ°āĻŋāĻ¯āĻŧ āĻ•āĻ°āĻžāĻ° āĻœāĻ¨ā§āĻ¯ āĻāĻ•āĻŸāĻŋ āĻŸā§āĻ˛āĨ¤ āĻāĻŸāĻŋ āĻ‡āĻ‰āĻ¸āĻŋāĻāĻ¸āĻ¸āĻŋ āĻœāĻŋāĻ¨ā§‹āĻŽ āĻŦā§āĻ°āĻžāĻ‰āĻœāĻžāĻ° āĻĨā§‡āĻ•ā§‡ āĻ‰āĻĒāĻ˛āĻŦā§āĻ§ >6,000 (āĻŽāĻžāĻ¨āĻŦ āĻœāĻŋāĻ¨ā§‹āĻŽ) āĻāĻĒāĻŋāĻœā§‡āĻ¨ā§‹āĻŽāĻŋāĻ• āĻŦā§ˆāĻļāĻŋāĻˇā§āĻŸā§āĻ¯āĻ—ā§āĻ˛āĻŋāĻ° āĻŦāĻŋāĻĒāĻ°ā§€āĻ¤ā§‡ āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ°āĻ•āĻžāĻ°ā§€-āĻĒā§āĻ°āĻĻāĻ¤ā§āĻ¤ āĻœāĻŋāĻ¨ā§‹āĻŽāĻŋāĻ• āĻ…āĻžā§āĻšāĻ˛āĻ—ā§āĻ˛āĻŋāĻ° (SNPs, ChIP-seq āĻŦāĻžāĻ‡āĻ¨ā§āĻĄāĻŋāĻ‚ āĻ¸āĻžāĻ‡āĻŸ āĻ‡āĻ¤ā§āĻ¯āĻžāĻĻāĻŋ) āĻŸā§€āĻ•āĻž āĻāĻŦāĻ‚ āĻ¸āĻŽā§ƒāĻĻā§āĻ§āĻ•āĻ°āĻŖ āĻŦāĻŋāĻļā§āĻ˛ā§‡āĻˇāĻŖ āĻ•āĻ°ā§‡āĨ¤

āĻ‡āĻ¨āĻĒā§āĻŸ - .bed āĻĢāĻ°āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻŸā§‡ āĻ¯ā§‡āĻ•ā§‹āĻ¨ āĻœāĻŋāĻ¨ā§‹āĻŽ-āĻ“āĻ¯āĻŧāĻžāĻ‡āĻĄ āĻĄā§‡āĻŸāĻž āĻĄā§‡āĻŸāĻž (chrom, chromStart, chromEnd āĻ¸āĻš āĻŸā§āĻ¯āĻžāĻŦ-āĻĄāĻŋāĻ˛āĻŋāĻŽāĻŋāĻŸā§‡āĻĄ āĻŸā§‡āĻ•ā§āĻ¸āĻŸ āĻĢāĻžāĻ‡āĻ˛)āĨ¤

āĻŸā§€āĻ•āĻž āĻŦāĻŋāĻļā§āĻ˛ā§‡āĻˇāĻŖ āĻ†āĻ‰āĻŸāĻĒā§āĻŸ - āĻ‡āĻ¨āĻĒā§āĻŸ āĻĄā§‡āĻŸāĻžāĻ¤ā§‡ āĻĒā§āĻ°āĻ¤āĻŋāĻŸāĻŋ āĻœāĻŋāĻ¨ā§‹āĻŽāĻŋāĻ• āĻ…āĻžā§āĻšāĻ˛ā§‡āĻ° āĻŦāĻŋāĻļāĻĻ āĻŸā§€āĻ•āĻžāĨ¤ āĻāĻĒāĻŋāĻœā§‡āĻ¨ā§‹āĻŽāĻŋāĻ• āĻŦā§ˆāĻļāĻŋāĻˇā§āĻŸā§āĻ¯ā§‡āĻ° āĻŽā§‹āĻŸ āĻ¸āĻ‚āĻ–ā§āĻ¯āĻž āĻĻā§āĻŦāĻžāĻ°āĻž āĻĒā§ƒāĻĨāĻ• āĻœāĻŋāĻ¨ā§‹āĻŽāĻŋāĻ• āĻ…āĻžā§āĻšāĻ˛āĻ•ā§‡ āĻ…āĻ—ā§āĻ°āĻžāĻ§āĻŋāĻ•āĻžāĻ° āĻĻāĻŋāĻ¤ā§‡ āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšā§ƒāĻ¤ āĻšāĻ¯āĻŧ āĻ¯āĻžāĻ° āĻ¸āĻžāĻĨā§‡ āĻ¤āĻžāĻ°āĻž āĻ¸āĻš-āĻ¸ā§āĻĨāĻžāĻ¨ā§€āĻ¯āĻŧ āĻ•āĻ°ā§‡āĨ¤

āĻ¸āĻŽā§ƒāĻĻā§āĻ§āĻ•āĻ°āĻŖ āĻŦāĻŋāĻļā§āĻ˛ā§‡āĻˇāĻŖ āĻ†āĻ‰āĻŸāĻĒā§āĻŸ - āĻŦāĻŋāĻļā§āĻ˛ā§‡āĻˇāĻŖā§‡āĻ° āĻœāĻ¨ā§āĻ¯ āĻ¨āĻŋāĻ°ā§āĻŦāĻžāĻšāĻŋāĻ¤ āĻœāĻŋāĻ¨ā§‹āĻŽ āĻŸā§€āĻ•āĻž āĻŦā§ˆāĻļāĻŋāĻˇā§āĻŸā§āĻ¯ āĻ¸āĻš āĻ‡āĻ¨āĻĒā§āĻŸ āĻœāĻŋāĻ¨ā§‹āĻŽ-āĻ“āĻ¯āĻŧāĻžāĻ‡āĻĄ āĻĄā§‡āĻŸāĻžāĻ° āĻĒāĻ°āĻŋāĻ¸āĻ‚āĻ–ā§āĻ¯āĻžāĻ¨āĻ—āĻ¤āĻ­āĻžāĻŦā§‡ āĻ‰āĻ˛ā§āĻ˛ā§‡āĻ–āĻ¯ā§‹āĻ—ā§āĻ¯ āĻ¸āĻš-āĻ¸ā§āĻĨāĻžāĻ¨ā§€āĻ¯āĻŧāĻ•āĻ°āĻŖā§‡āĻ° p-āĻŽāĻžāĻ¨āĨ¤ āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ°āĻ•āĻžāĻ°ā§€āĻ° āĻĄā§‡āĻŸāĻžāĻ° āĻ¸āĻžāĻĨā§‡ āĻ¯ā§āĻ•ā§āĻ¤ āĻāĻĒāĻŋāĻœā§‡āĻ¨ā§‹āĻŽāĻŋāĻ• āĻŦā§ˆāĻļāĻŋāĻˇā§āĻŸā§āĻ¯āĻ—ā§āĻ˛āĻŋāĻ•ā§‡ āĻ…āĻ—ā§āĻ°āĻžāĻ§āĻŋāĻ•āĻžāĻ° āĻĻāĻŋāĻ¤ā§‡ āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšā§ƒāĻ¤ āĻšāĻ¯āĻŧāĨ¤



āĻŦā§ˆāĻļāĻŋāĻˇā§āĻŸā§āĻ¯

  • āĻœāĻŋāĻ¨ā§‹āĻŽāĻŋāĻ• āĻ…āĻžā§āĻšāĻ˛ā§‡āĻ° āĻŦāĻŋāĻļā§āĻ˛ā§‡āĻˇāĻŖ (ChIP-seq, RNA-seq, DNA āĻŽāĻŋāĻĨāĻŋāĻ˛ā§‡āĻļāĻ¨, SNPs/CNVs āĻ‡āĻ¤ā§āĻ¯āĻžāĻĻāĻŋ)
  • āĻĄā§‡āĻŸāĻž āĻāĻ¨āĻ•ā§‹āĻĄ āĻ•āĻ°ā§āĻ¨
  • āĻŸā§€āĻ•āĻž āĻāĻŦāĻ‚ āĻ¸āĻŽā§ƒāĻĻā§āĻ§āĻŋ āĻŦāĻŋāĻļā§āĻ˛ā§‡āĻˇāĻŖ
  • BED āĻĢāĻžāĻ‡āĻ˛ āĻĢāĻ°āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻŸ (chrom, chromStart, chromEnd)
  • āĻ­āĻŋāĻĄāĻŋāĻ“ āĻ“āĻ­āĻžāĻ°āĻ­āĻŋāĻ‰ (http://youtu.be/v9p9FClrqXU)


āĻĒāĻžāĻ āĻ•āĻŦāĻ°ā§āĻ—

āĻŦāĻŋāĻœā§āĻžāĻžāĻ¨/āĻ—āĻŦā§‡āĻˇāĻŖāĻž, āĻļā§‡āĻˇ āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ°āĻ•āĻžāĻ°ā§€/āĻĄā§‡āĻ¸ā§āĻ•āĻŸāĻĒ


āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ°āĻ•āĻžāĻ°ā§€ āĻ‡āĻ¨ā§āĻŸāĻžāĻ°āĻĢā§‡āĻ¸

āĻĒā§āĻ°āĻœā§‡āĻ•ā§āĻŸ āĻāĻ•āĻŸāĻŋ āĻ‡āĻ‰āĻœāĻžāĻ° āĻ‡āĻ¨ā§āĻŸāĻžāĻ°āĻĢā§‡āĻ¸ (UI) āĻ¸āĻŋāĻ¸ā§āĻŸā§‡āĻŽ


āĻĒā§āĻ°ā§‹āĻ—ā§āĻ°āĻžāĻŽāĻŋāĻ‚ āĻ­āĻžāĻˇāĻž

āĻ­āĻŋāĻœā§āĻ¯ā§āĻ¯āĻŧāĻžāĻ˛ āĻŦā§‡āĻ¸āĻŋāĻ•āĨ¤ āĻ¨ā§‡āĻŸ


āĻĄāĻžāĻŸāĻžāĻŦā§‡āĻ¸ āĻĒāĻ°āĻŋāĻŦā§‡āĻļ

āĻāĻ¸āĻ•āĻŋāĻ‰āĻāĻ˛-āĻ­āĻŋāĻ¤ā§āĻ¤āĻŋāĻ•



āĻŦāĻŋāĻ­āĻžāĻ—

āĻœā§ˆāĻŦ-āĻ¤āĻĨā§āĻ¯āĻŦāĻŋāĻĻā§āĻ¯āĻž, āĻ¤āĻĨā§āĻ¯ āĻŦāĻŋāĻļā§āĻ˛ā§‡āĻˇāĻŖ

āĻāĻŸāĻŋ āĻāĻŽāĻ¨ āĻāĻ•āĻŸāĻŋ āĻ…ā§āĻ¯āĻžāĻĒā§āĻ˛āĻŋāĻ•ā§‡āĻļāĻ¨ āĻ¯āĻž https://sourceforge.net/projects/genomerunner/ āĻĨā§‡āĻ•ā§‡āĻ“ āĻ†āĻ¨āĻž āĻ¯ā§‡āĻ¤ā§‡ āĻĒāĻžāĻ°ā§‡āĨ¤ āĻ†āĻŽāĻžāĻĻā§‡āĻ° āĻŦāĻŋāĻ¨āĻžāĻŽā§‚āĻ˛ā§āĻ¯ā§‡āĻ° āĻ…āĻĒāĻžāĻ°ā§‡āĻŸāĻŋāĻ­ āĻ¸āĻŋāĻ¸ā§āĻŸā§‡āĻŽāĻ—ā§āĻ˛āĻŋāĻ° āĻŽāĻ§ā§āĻ¯ā§‡ āĻāĻ•āĻŸāĻŋ āĻĨā§‡āĻ•ā§‡ āĻ¸āĻŦāĻšā§‡āĻ¯āĻŧā§‡ āĻ¸āĻšāĻœ āĻ‰āĻĒāĻžāĻ¯āĻŧā§‡ āĻ…āĻ¨āĻ˛āĻžāĻ‡āĻ¨ā§‡ āĻšāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§‹āĻ° āĻœāĻ¨ā§āĻ¯ āĻāĻŸāĻŋ OnWorks-āĻ āĻšā§‹āĻ¸ā§āĻŸ āĻ•āĻ°āĻž āĻšāĻ¯āĻŧā§‡āĻ›ā§‡āĨ¤


āĻŦāĻŋāĻ¨āĻžāĻŽā§‚āĻ˛ā§āĻ¯ā§‡ āĻ¸āĻžāĻ°ā§āĻ­āĻžāĻ° āĻāĻŦāĻ‚ āĻ“āĻ¯āĻŧāĻžāĻ°ā§āĻ•āĻ¸ā§āĻŸā§‡āĻļāĻ¨

āĻ‰āĻ‡āĻ¨ā§āĻĄā§‹āĻœ āĻāĻŦāĻ‚ āĻ˛āĻŋāĻ¨āĻžāĻ•ā§āĻ¸ āĻ…ā§āĻ¯āĻžāĻĒ āĻĄāĻžāĻ‰āĻ¨āĻ˛ā§‹āĻĄ āĻ•āĻ°ā§āĻ¨

  • 1
    Phaser
    Phaser
    Phaser āĻāĻ•āĻŸāĻŋ āĻĻā§āĻ°ā§āĻ¤, āĻŦāĻŋāĻ¨āĻžāĻŽā§‚āĻ˛ā§āĻ¯ā§‡, āĻāĻŦāĻ‚ āĻŽāĻœāĻžāĻ° āĻ–ā§‹āĻ˛āĻž
    āĻ‰ā§ŽāĻ¸ HTML5 āĻ—ā§‡āĻŽ āĻĢā§āĻ°ā§‡āĻŽāĻ“āĻ¯āĻŧāĻžāĻ°ā§āĻ• āĻ…āĻĢāĻžāĻ° āĻ•āĻ°ā§‡
    WebGL āĻāĻŦāĻ‚ āĻ•ā§āĻ¯āĻžāĻ¨āĻ­āĻžāĻ¸ āĻ°ā§‡āĻ¨ā§āĻĄāĻžāĻ°āĻŋāĻ‚ āĻœā§āĻĄāĻŧā§‡
    āĻĄā§‡āĻ¸ā§āĻ•āĻŸāĻĒ āĻāĻŦāĻ‚ āĻŽā§‹āĻŦāĻžāĻ‡āĻ˛ āĻ“āĻ¯āĻŧā§‡āĻŦ āĻŦā§āĻ°āĻžāĻ‰āĻœāĻžāĻ°āĨ¤ āĻ—ā§‡āĻŽāĻ¸
    āĻ¸āĻš āĻšāĻ¤ā§‡ āĻĒāĻžāĻ°ā§‡...
    Phaser āĻĄāĻžāĻ‰āĻ¨āĻ˛ā§‹āĻĄ āĻ•āĻ°ā§āĻ¨
  • 2
    āĻ­āĻžāĻ¸āĻžāĻ˛ āĻ‡āĻžā§āĻœāĻŋāĻ¨
    āĻ­āĻžāĻ¸āĻžāĻ˛ āĻ‡āĻžā§āĻœāĻŋāĻ¨
    VASSAL āĻ¤ā§ˆāĻ°āĻŋāĻ° āĻœāĻ¨ā§āĻ¯ āĻāĻ•āĻŸāĻŋ āĻ—ā§‡āĻŽ āĻ‡āĻžā§āĻœāĻŋāĻ¨
    āĻāĻ¤āĻŋāĻšā§āĻ¯āĻ—āĻ¤ āĻŦā§‹āĻ°ā§āĻĄā§‡āĻ° āĻ‡āĻ˛ā§‡āĻ•āĻŸā§āĻ°āĻ¨āĻŋāĻ• āĻ¸āĻ‚āĻ¸ā§āĻ•āĻ°āĻŖ
    āĻāĻŦāĻ‚ āĻ•āĻžāĻ°ā§āĻĄ āĻ—ā§‡āĻŽāĨ¤ āĻāĻŸāĻŋ āĻœāĻ¨ā§āĻ¯ āĻ¸āĻŽāĻ°ā§āĻĨāĻ¨ āĻĒā§āĻ°āĻĻāĻžāĻ¨ āĻ•āĻ°ā§‡
    āĻ—ā§‡āĻŽ āĻĒāĻŋāĻ¸ āĻ°ā§‡āĻ¨ā§āĻĄāĻžāĻ°āĻŋāĻ‚ āĻāĻŦāĻ‚ āĻŽāĻŋāĻĨāĻ¸ā§āĻ•ā§āĻ°āĻŋāĻ¯āĻŧāĻž,
    āĻāĻŦāĻ‚...
    āĻ­āĻžāĻ¸āĻžāĻ˛ āĻ‡āĻžā§āĻœāĻŋāĻ¨ āĻĄāĻžāĻ‰āĻ¨āĻ˛ā§‹āĻĄ āĻ•āĻ°ā§āĻ¨
  • 3
    OpenPDF - iText āĻāĻ° āĻ•āĻžāĻāĻŸāĻž
    OpenPDF - iText āĻāĻ° āĻ•āĻžāĻāĻŸāĻž
    OpenPDF āĻ¤ā§ˆāĻ°āĻŋāĻ° āĻœāĻ¨ā§āĻ¯ āĻāĻ•āĻŸāĻŋ āĻœāĻžāĻ­āĻž āĻ˛āĻžāĻ‡āĻŦā§āĻ°ā§‡āĻ°āĻŋ
    āĻāĻŦāĻ‚ LGPL āĻĻāĻŋāĻ¯āĻŧā§‡ PDF āĻĢāĻžāĻ‡āĻ˛ āĻ¸āĻŽā§āĻĒāĻžāĻĻāĻ¨āĻž āĻ•āĻ°āĻž āĻāĻŦāĻ‚
    āĻāĻŽāĻĒāĻŋāĻāĻ˛ āĻ“āĻĒā§‡āĻ¨ āĻ¸ā§‹āĻ°ā§āĻ¸ āĻ˛āĻžāĻ‡āĻ¸ā§‡āĻ¨ā§āĻ¸āĨ¤ OpenPDF āĻšāĻ˛
    LGPL/MPL āĻ“āĻĒā§‡āĻ¨ āĻ¸ā§‹āĻ°ā§āĻ¸ iText āĻāĻ° āĻ‰āĻ¤ā§āĻ¤āĻ°āĻ¸ā§‚āĻ°āĻŋ,
    āĻ†āĻ›ā§‡ ...
    OpenPDF āĻĄāĻžāĻ‰āĻ¨āĻ˛ā§‹āĻĄ āĻ•āĻ°ā§āĻ¨ - iText āĻāĻ° āĻĢāĻ°ā§āĻ•
  • 4
    āĻ¸āĻžāĻ—āĻž āĻœāĻŋāĻ†āĻ‡āĻāĻ¸
    āĻ¸āĻžāĻ—āĻž āĻœāĻŋāĻ†āĻ‡āĻāĻ¸
    SAGA - āĻ¸ā§āĻŦāĻ¯āĻŧāĻ‚āĻ•ā§āĻ°āĻŋāĻ¯āĻŧ āĻœāĻ¨ā§āĻ¯ āĻ¸āĻŋāĻ¸ā§āĻŸā§‡āĻŽ
    āĻ­ā§‚-āĻŦā§ˆāĻœā§āĻžāĻžāĻ¨āĻŋāĻ• āĻŦāĻŋāĻļā§āĻ˛ā§‡āĻˇāĻŖ - āĻāĻ•āĻŸāĻŋ āĻ­ā§ŒāĻ—āĻ˛āĻŋāĻ•
    āĻ¸āĻžāĻĨā§‡ āĻ‡āĻ¨āĻĢāĻ°āĻŽā§‡āĻļāĻ¨ āĻ¸āĻŋāĻ¸ā§āĻŸā§‡āĻŽ (GIS) āĻ¸āĻĢāĻŸāĻ“āĻ¯āĻŧā§āĻ¯āĻžāĻ°
    āĻœāĻŋāĻ“āĻĄāĻžāĻŸāĻžāĻ° āĻœāĻ¨ā§āĻ¯ āĻŦāĻŋāĻļāĻžāĻ˛ āĻ•ā§āĻˇāĻŽāĻ¤āĻž
    āĻĒā§āĻ°āĻ•ā§āĻ°āĻŋāĻ¯āĻŧāĻžāĻ•āĻ°āĻŖ āĻāĻŦāĻ‚ ana...
    SAGA GIS āĻĄāĻžāĻ‰āĻ¨āĻ˛ā§‹āĻĄ āĻ•āĻ°ā§āĻ¨
  • 5
    Java/JTOpen āĻāĻ° āĻœāĻ¨ā§āĻ¯ āĻŸā§āĻ˛āĻŦāĻ•ā§āĻ¸
    Java/JTOpen āĻāĻ° āĻœāĻ¨ā§āĻ¯ āĻŸā§āĻ˛āĻŦāĻ•ā§āĻ¸
    Java/JTOpen āĻāĻ° āĻœāĻ¨ā§āĻ¯ IBM āĻŸā§āĻ˛āĻŦāĻ•ā§āĻ¸ āĻšāĻ˛ a
    āĻœāĻžāĻ­āĻž āĻ•ā§āĻ˛āĻžāĻ¸ā§‡āĻ° āĻ˛āĻžāĻ‡āĻŦā§āĻ°ā§‡āĻ°āĻŋ āĻ¸āĻŽāĻ°ā§āĻĨāĻ¨ āĻ•āĻ°ā§‡
    āĻ•ā§āĻ˛āĻžāĻ¯āĻŧā§‡āĻ¨ā§āĻŸ/āĻ¸āĻžāĻ°ā§āĻ­āĻžāĻ° āĻāĻŦāĻ‚ āĻ‡āĻ¨ā§āĻŸāĻžāĻ°āĻ¨ā§‡āĻŸ āĻĒā§āĻ°ā§‹āĻ—ā§āĻ°āĻžāĻŽāĻŋāĻ‚
    OS/400 āĻšāĻžāĻ˛āĻŋāĻ¤ āĻāĻ•āĻŸāĻŋ āĻ¸āĻŋāĻ¸ā§āĻŸā§‡āĻŽā§‡āĻ° āĻŽāĻĄā§‡āĻ˛,
    i5/OS, o...
    Java/JTOpen āĻāĻ° āĻœāĻ¨ā§āĻ¯ āĻŸā§āĻ˛āĻŦāĻ•ā§āĻ¸ āĻĄāĻžāĻ‰āĻ¨āĻ˛ā§‹āĻĄ āĻ•āĻ°ā§āĻ¨
  • 6
    D3.js
    D3.js
    D3.js (āĻŦāĻž āĻĄā§‡āĻŸāĻž-āĻšāĻžāĻ˛āĻŋāĻ¤ āĻ¨āĻĨāĻŋāĻ—ā§āĻ˛āĻŋāĻ° āĻœāĻ¨ā§āĻ¯ D3)
    āĻāĻ•āĻŸāĻŋ āĻœāĻžāĻ­āĻžāĻ¸ā§āĻ•ā§āĻ°āĻŋāĻĒā§āĻŸ āĻ˛āĻžāĻ‡āĻŦā§āĻ°ā§‡āĻ°āĻŋ āĻ¯āĻž āĻ†āĻĒāĻ¨āĻžāĻ•ā§‡ āĻ…āĻ¨ā§āĻŽāĻ¤āĻŋ āĻĻā§‡āĻ¯āĻŧ
    āĻ—āĻ¤āĻŋāĻļā§€āĻ˛, āĻ‡āĻ¨ā§āĻŸāĻžāĻ°ā§‡āĻ•ā§āĻŸāĻŋāĻ­ āĻĄā§‡āĻŸāĻž āĻ¤ā§ˆāĻ°āĻŋ āĻ•āĻ°āĻ¤ā§‡
    āĻ“āĻ¯āĻŧā§‡āĻŦ āĻŦā§āĻ°āĻžāĻ‰āĻœāĻžāĻ°ā§‡ āĻ­āĻŋāĻœā§āĻ¯ā§āĻ¯āĻŧāĻžāĻ˛āĻžāĻ‡āĻœā§‡āĻļāĻ¨āĨ¤ D3 āĻ¸āĻš
    āĻ†āĻĒāĻ¨āĻŋ...
    D3.js āĻĄāĻžāĻ‰āĻ¨āĻ˛ā§‹āĻĄ āĻ•āĻ°ā§āĻ¨
  • āĻ†āĻ°āĻ“ Âģ

āĻ˛āĻŋāĻ¨āĻžāĻ•ā§āĻ¸ āĻ•āĻŽāĻžāĻ¨ā§āĻĄāĻ—ā§āĻ˛āĻŋ

Ad