উইন্ডোজের জন্য gsasnp2 ডাউনলোড করুন

এটি gsasnp2 নামে একটি উইন্ডোজ অ্যাপ যার সর্বশেষ রিলিজটি gsasnp2-linux-cmd-ubuntu.zip হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।

স্ক্রীনশটগুলি

gsasnp2

বর্ণনাঃ

* GSA-SNP2 হল GSA-SNP এর উত্তরসূরী (Nam et al. 2010, NAR ওয়েব সার্ভার সমস্যা)। GSA-SNP2 মানব GWAS সারাংশ ডেটা (rs সংখ্যা, p-মান) বা জিন-ভিত্তিক পি-মান গ্রহণ করে এবং প্রদত্ত ফেনোটাইপের সাথে যুক্ত জিনগুলির সাথে পাথওয়ে জিনসেট 'সমৃদ্ধ' আউটপুট করে। এটি সংশ্লিষ্ট পথগুলিতে স্থানীয় এবং বিশ্বব্যাপী উভয় প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া নেটওয়ার্ক সরবরাহ করে।

* প্রবন্ধ: SYoon, HCTNguyen, YJYoo, JKim, BBaik, SKim, JKim, SKim, DNam, "GSA-SNP2 ব্যবহার করে GWAS সারাংশ ডেটার দক্ষ পাথওয়ে সমৃদ্ধকরণ এবং নেটওয়ার্ক বিশ্লেষণ", নিউক্লিক অ্যাসিড গবেষণা, ভলিউম। 46(10), e60(2018)।

* পাবমেড আইডি: 29562348

* DOI: 10.1093/nar/gky175

-> অনুগ্রহ করে আপনার নিবিড় পরীক্ষার ফোল্ডারে (যেমন লিনাক্স, ম্যাক বা উইন্ডোজ নির্দিষ্ট ফোল্ডার) 'ডেটা' ফোল্ডারের একটি অনুলিপি সরান বা তৈরি করুন যাতে প্রোগ্রামটিকে পূর্বনির্ধারিত দাতা খুঁজে পেতে অনুমতি দেওয়া হয়।

* আপডেট নোট:
-> Sep-1-2020: Ubuntu-20.04-এর জন্য একটি আপডেট যোগ করুন। আপনাকে বুস্ট লাইব্রেরি ইনস্টল করতে হবে (sudo apt-get install libboost-all-dev)
-> মার্চ-7-2018: আউটপুট ফাইলে শিরোনামের শর্তাবলী সংশোধন করুন

বৈশিষ্ট্য

• 1/ 'শালীন প্রকার I ত্রুটি নিয়ন্ত্রণ' নিম্নলিখিত দুটি প্রক্রিয়া দ্বারা অর্জিত: ক) একঘেয়ে ঘন ঘন স্প্লাইন প্রবণতা বক্ররেখা ব্যবহার করে প্রতিটি জিনের জন্য নির্ধারিত SNP-এর সংখ্যার সাথে জিনের স্কোরগুলি 'সামঞ্জস্য' করা হয়। খ) প্রতিটি পথের মধ্যে উচ্চ আন্তঃ-জিন পারস্পরিক সম্পর্ক সহ সংলগ্ন জিনগুলি সরানো হয়েছিল
• 2/ এলোমেলো সেট মডেলের উপর ভিত্তি করে 'হাই পাওয়ার এবং ফাস্ট কম্পিউটেশন'
• 3/ 'কোনও ক্রিটিক্যাল ফ্রি প্যারামিটার নেই'
• 4/ সদস্য জিনের মধ্যে 'প্রোটিন ইন্টারঅ্যাকশন নেটওয়ার্ক' উল্লেখযোগ্য পথের জন্য কল্পনা করা হয়েছিল। এই ফাংশনটি ব্যবহারকারীকে গুরুত্বপূর্ণ পথের মধ্যে এবং জুড়ে মূল উপ-নেটওয়ার্কগুলিকে অগ্রাধিকার দিতে সক্ষম করে। STRING এবং HIPPIE নেটওয়ার্কগুলি বর্তমানে প্রদান করা হয়েছে৷
• 5/ 'ব্যবহার করা সহজ': এটির জন্য শুধুমাত্র GWAS সারাংশ ডেটা (বা জিন পি-মান) প্রয়োজন এবং ফলাফল পেতে মাত্র এক বা দুই মিনিট সময় লাগে৷ অন্যান্য শক্তিশালী স্বয়ংসম্পূর্ণ পাথওয়ে সরঞ্জামগুলির জন্যও SNP পারস্পরিক সম্পর্ক ইনপুট প্রয়োজন এবং অনেক বেশি সময় নেয়। ব্যবহারকারী তাদের নিজস্ব পাথওয়ে জিন-সেট এবং প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া নেটওয়ার্ক আপলোড করতে পারেন।

ব্যবহারকারী ইন্টারফেস

Win32 (MS Windows), কমান্ড লাইন

প্রোগ্রামিং ভাষা

সি++, পিএইচপি, জাভাস্ক্রিপ্ট

বিভাগ

এটি একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/gsasnp2/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।