Dies ist der Befehl bp_multi_hmmsearch.plp, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
multi_hmmsearch – führt eine hmmsearch in mehreren FASTA-Dateien durch mit
eine INDEX-Datei
ZUSAMMENFASSUNG
multi_hmmsearch -p hmm_file [-i] -f index_file
BESCHREIBUNG
Technisch gesehen kein Bio::Tools::Run-Skript, da dieses kein Bioperl oder Bioperl-run verwendet
Komponenten, aber es ist nützlich.
Verpflichtend Option:
-p HMM-Profil, das für die Suche verwendet werden soll.
-f INDEX-Datei, die eine Liste der FASTA-Dateien für das Multiple enthält
Suche.
Spezial Option:
-i Erstellt eine neue Indexdatei mit den resultierenden HMMS-Dateien. Das ist
nützlich, wenn Sie diese Liste als Eingabeargumente an übergeben möchten
andere Programme.
-h Diese Dokumentation anzeigen.
FEEDBACK
Postsendung Listen
Benutzerfeedback ist ein wesentlicher Bestandteil der Weiterentwicklung dieses und anderer Bioperl-Module. Senden
Ihre Kommentare und Anregungen vorzugsweise an die Bioperl-Mailingliste. Deine Teilnahme
wird sehr geschätzt.
[E-Mail geschützt] - Allgemeine Diskussion
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - Über die Mailinglisten
Reporting Fehler
Melden Sie Fehler an das Bug-Tracking-System von Bioperl, damit wir die Fehler und ihre Fehler im Auge behalten können
Auflösung. Fehlerberichte können über das Web eingereicht werden:
http://redmine.open-bio.org/projects/bioperl/
Verwenden Sie bp_multi_hmmsearch.plp online über die Dienste von onworks.net
