Dies ist der Befehl createChemistryHeader, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
createChemistryHeader.py – Erstellen Sie einen SAM-Header mit PacBio-Sequenzierungschemie
Information
BESCHREIBUNG
Verwendung: getChemistryHeader.py [-h] [--debug] --bas_files BAS_FILES
[BAS_FILES ...]
Eingabe_Ausrichtungsdatei Ausgabe_Header_Datei
createChemistryHeader erstellt einen SAM-Header, der die von verwendeten Chemieinformationen enthält
Köcher.
positionell Argumente:
input_alignment_file
Eine von BLASR erstellte SAM- oder BAM-Datei.
Ausgabekopfdatei
Name der SAM- oder BAM-Headerdatei, die mit Chemieinformationen erstellt wird
geladen.
optional Argumente:
-h, --help
Diese Hilfemeldung anzeigen und beenden
--debuggen
Detaillierte Protokollinformationen ausgeben. (Standard: Falsch)
--bas_files BAS_FILES [BAS_FILES ...]
Die BAS- oder BAX-Dateien mit den Lesevorgängen, die im ausgerichtet wurden
input_alignment_file. Kann auch ein Fofn von BAS- oder BAX-Dateien sein. (Standard: Keine)
Verwenden Sie createChemistryHeader online über die Dienste von onworks.net
