Dies ist der Befehl gbrowse_syn_load_alignment_database, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
gbrowse_syn_load_alignment_database – Skript zum Laden der Datenbank für gbrowse_syn
BESCHREIBUNG
Das erwartete Dateiformat ist tabulatorgetrennt (siehe unten):
Spezies1 Ref1 Start1 Ende1 Strang1 Zigarrenzeichenfolge1 Spezies2 Ref2 Start2 Ende2 Strang2
cigar_string2 coords1... | Koordinaten2...
das Koordinatenformat: pos1_species1 pos1_species2 ... posn_species1 posn_species2 |
pos1_species2 pos1_species1 ... posn_species2 posn_species1,
Dabei ist pos die übereinstimmende Sequenzkoordinate (ohne Lücke) in jeder Art.
Verwenden Sie gbrowse_syn_load_alignment_database online über die Dienste von onworks.net
