Dies ist der Befehl gt-seqmutate, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
gt-seqmutate – Mutiert die Sequenzen der angegebenen Sequenzdatei(en).
ZUSAMMENFASSUNG
gt seqmutieren [Option ...] [sequence_file ...]
BESCHREIBUNG
-Bewertung [Wert]
Legen Sie die Mutationsrate fest (Standard: 1)
-Breite [Wert]
Ausgabebreite für FASTA-Sequenzdruck festlegen (0 deaktiviert die Formatierung) (Standard: 0)
-o [Dateinamen]
Ausgabe an angegebene Datei umleiten (Standard: undefiniert)
-gzip [ja|nein]
gzip komprimierte Ausgabedatei schreiben (Standard: nein)
-bzip2 [ja|nein]
bzip2-komprimierte Ausgabedatei schreiben (Standard: nein)
-Macht [ja|nein]
Schreiben in Ausgabedatei erzwingen (Standard: nein)
-Hilfe
Hilfe anzeigen und beenden
-Ausführung
Versionsinformationen anzeigen und beenden
Für jede Position in den angegebenen Sequenzen wird sie zufällig mit Wahrscheinlichkeit bestimmt
(Mutationsrate / 100), wenn die angegebene Position mutiert ist. Wenn ja, in 80 % der Fälle a
Es erfolgt eine Substitution, in 10 % eine Einfügung bzw. in 10 % eine Löschung. Für
Bei Substitutions- und Insertionsereignissen wird das Nukleotid zufällig generiert, ohne Rücksicht darauf
das ursprüngliche Nukleotid. Das heißt, Neusubstitutionen sind möglich. Dieses Verfahren entspricht dem
eine davon ist auf Seite 1867 des folgenden Artikels beschrieben:
TD Wu und CK Watanabe. GMAP: a genomische Mapping und Ausrichtung Programm für mRNA und EST
Sequenzen. Bioinformatik, 21(9): 1859-1875, 2005
REPORTING Fehler
Fehler melden an[E-Mail geschützt] >.
Verwenden Sie gt-seqmutate online über die Dienste von onworks.net
