Dies ist der Befehl gt-tallymer-search, der im kostenlosen OnWorks-Hosting-Provider mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, Windows-Online-Emulator oder MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
gt-tallymer-search - Suche nach einer Menge von k-mers in einem Index, der von ``gt tallymer . erstellt wurde
mkindex''.
ZUSAMMENFASSUNG
gt Tallymer search [Optionen] -tyr tallymer-index -q Abfragedatei0 [Abfragedatei1..] [Optionen]
BESCHREIBUNG
-tyr [Schnur]
Tallymer-Index angeben (Standard: undefiniert)
-q
Namen der Abfragedatei angeben
-Strand [Schnur]
Geben Sie den zu durchsuchenden Strang an: verwenden Sie f (für Vorwärtsstrang) oder p (für Rückwärtsstrang)
komplementierter Strang) oder fp (für beide); Standard ist f (Standard: f)
-Ausgang
Ausgabeflags angeben (qseqnum, qpos, counts, sequence)
-v [ja|nein]
ausführlich sein (Standard: nein)
-Hilfe
Hilfe anzeigen und beenden
-Ausführung
Versionsinformationen anzeigen und beenden
REPORTING Fehler
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