Dies ist der letzte Befehl, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
last-split – Schätzt „geteilte“ oder „gespleißte“ Ausrichtungen.
ZUSAMMENFASSUNG
letzte Teilung [Optionen] LAST-alignments.maf
BESCHREIBUNG
Lesen Sie Alignments von Abfragesequenzen zu einem Genom und schätzen Sie die genomische Quelle jeder Sequenz ab
Teil jeder Abfrage, sodass verschiedene Teile einer Abfrage aus verschiedenen Teilen von stammen können
das Genom.
OPTIONAL
-h, --help
Diese Hilfemeldung anzeigen und beenden
-g, --Genom=NAME/FUNKTION
lastdb-Genomname
-d, --Richtung=D
RNA-Richtung: 0=rückwärts, 1=vorwärts, 2=gemischt (Standard=1)
-c, --cis=PROB
Cis-Spleißwahrscheinlichkeit pro Base (Standard = 0.004)
-t, --trans=PROB
Transspleißwahrscheinlichkeit pro Basis (Standard=1e-05)
-M, --bedeuten=MEAN
Mittelwert von ln[Intronlänge] (Standard=7)
-S, --sdev=SDEV
Standardabweichung von ln[Intronlänge] (Standard = 1.7)
-m, - Fehlzuordnung=PROB
maximale Fehlzuordnungswahrscheinlichkeit (Standard = 0.01)
-s, --Spielstand=INT
Mindestausrichtungspunktzahl (Standard=e ODER e+t*ln[1000])
-n, --nicht teilen
Schreiben Sie originale, nicht geteilte Ausrichtungen
-v, - ausführlich
sei ausführlich
-V, --Version
Versionsinformationen anzeigen und beenden
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