Dies ist der Befehl maf-convert, der im kostenlosen OnWorks-Hosting-Provider mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, Windows-Online-Emulator oder MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
maf-convert - Konvertiert Ausrichtungen im MAF-Format in ein Tabellenformat
BESCHREIBUNG
Verwendung:
maf-konvertieren --help maf-convert axt mafDatei(en) maf-convert blast mafDatei(en)
MAF-Konvertierung Blasttab MAF-Datei(en) MAF-Konvertierung HTML MAF-Datei(en) MAF-Konvertierung PSL
mafFile(s) maf-convert sam mafFile(s) maf-convert tab mafFile(s)
Lesen Sie Ausrichtungen im MAF-Format und schreiben Sie sie in ein anderes Format.
OPTIONAL
-h, --help
Diese Hilfemeldung anzeigen und beenden
-p, --Protein
Annahme von Protein-Alignments, für psl-Match-Zählungen
-n, --noheader
lassen Sie alle Kopfzeilen von der Ausgabe weg
-d, --Wörterbuch
Wörterbuch der Sequenzlängen im sam-Format einschließen
-f DICTFILE, --dictfile=DICTFILE
Sequenz-Wörterbuch von DICTFILE holen
-r GRUPPE LESEN, - Lesegruppe=GRUPPE LESEN
Gruppeninfo für Sam-Format lesen
-l LINIENGRÖSSE, --Liniengröße=LINIENGRÖSSE
Zeilenlänge für Blast- und HTML-Formate (Standard: 60)
Verwenden Sie maf-convert online mit den onworks.net-Diensten
