obspectrophore - Online in der Cloud

PROGRAMM:

NAME/FUNKTION

Obspektrophore — SPECTROPHORE-Rechner

ZUSAMMENFASSUNG

Obspektrophore [Optionen] -i Eingabedatei

Obspektrophore [-u | -h]

BESCHREIBUNG

Obspektrophore kann verwendet werden, um Spektrophore zu erzeugen, die eindimensionale Deskriptoren sind
aus den die Moleküle umgebenden Eigenschaftsfeldern erzeugt. Diese Technologie ermöglicht die
genaue Beschreibung von Molekülen in Bezug auf ihre Oberflächeneigenschaften oder Felder. Vergleich
der Eigenschaftsfelder von Molekülen bietet eine robuste, strukturunabhängige Methode zur Ausrichtung
Wirkstoffe aus verschiedenen chemischen Klassen. Bei Anwendung auf Moleküle wie Liganden und
Spektrophore können als aussagekräftige molekulare Deskriptoren in den Bereichen
Chemoinformatik, virtuelles Screening und QSAR-Modellierung.

OPTIONAL

-i Datei
Gibt die molekulare Eingabedatei an, aus der Spektrophore berechnet werden sollen. Die
Dateityp wird automatisch anhand der Dateierweiterung erkannt.

-n Wert
Gibt die Art der Normalisierung an, die durchgeführt werden soll. Gültige Werte sind
(ohne Anführungszeichen): Nein (Standard), Null Bedeutung, EinheitStd und ZeroMeanAndUnitStd.

-a Wert
Gibt die erforderliche Genauigkeit, ausgedrückt als Winkelschrittweite, an. Nur folgendes
diskrete Werte sind erlaubt: 1 | 2 | 5 | 10 | 15 | 20 (Standard) | 30 | 36 | 45 | 60

-s Wert
Gibt die Art von Käfigen an, die in Bezug auf die zugrunde liegende Punktgruppe verwendet werden sollen:
P1 oder P-1. Gültige Werte sind (ohne Anführungszeichen): Nein (Standard), So einzigartig wie Sie:, Spiegel und Alle.

-r Wert
Gibt die erforderliche Auflösung als reelle positive Zahl an. Der Standard
Wert ist 3.0 Angström. Negative Werte oder ein Wert gleich 0 erzeugen einen Fehler
Nachricht.

-u Implementierungsdetails anzeigen.

-h Hilfemeldung anzeigen.

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