Dies ist der Befehl sim2gff, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
sim2gff – Konvertiert SIM-Dateien in GFF-formatierte Datensätze
ZUSAMMENFASSUNG
sim2gff [-frxyHh] sim_file > gff_file
BESCHREIBUNG
Diese Handbuchseite dokumentiert kurz die sim2gff Befehl.
sim2gff ist ein in Perl geschriebenes Programm, das SIM-Dateien in GFF-formatierte Datensätze konvertiert
(zur Verwendung mit gff2aplot und gff2javaplot).
OPTIONAL
-H, --help
Zusammenfassung der Optionen anzeigen.
-f Die Ausgabe wird in eine Datei mit dem Namen geschrieben .gff.
-r Vertauschen Sie die Reihenfolge der Sequenzen (Seq1 auf der y-Achse, Seq2 auf der x-Achse).
-x
Geben Sie den Artennamen für Art1 an (Standard: „Seq1“).
-y
Geben Sie den Artennamen für Art2 an (Standard: „Seq2“).
-H Verwenden Sie die Fasta-Dateikopfzeilen für Artenbezeichnungen.
EXIT STATUS
Der folgende Perl-ähnliche Exit-Status wird zurückgegeben:
0 Fehler
1 Erfolgreiche Fertigstellung
Nutzen Sie sim2gff online über die Dienste von onworks.net
