Dies ist die Befehlsdrehung, die im kostenlosen OnWorks-Hosting-Provider mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, Windows-Online-Emulator oder MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
spin - DNA-Bearbeitungs- und Analysetool (Teil des Staden-Pakets)
ZUSAMMENFASSUNG
spinnen [Optionen]
BESCHREIBUNG
Spin ist ein interaktives und grafisches Programm zum Analysieren und Vergleichen von Sequenzen. Es
enthält Funktionen zur Suche nach Restriktionsstellen, Konsensussequenzen/-motiven und Proteinen
kodierende Regionen, können die Zusammensetzung der Sequenz analysieren und DNA in Protein übersetzen.
Es enthält auch Funktionen zum Auffinden von Ähnlichkeitssegmenten innerhalb und zwischen
Sequenzen und zum Finden globaler und lokaler Alignments zwischen Sequenzpaaren. Helfen
die statistische Signifikanz von Vergleichen beurteilen Das Programm kann Tabellen von berechnen
erwartete und beobachtete Score-Häufigkeiten für jede Score-Stufe. Die meisten analytischen Funktionen
die mit einzelnen Sequenzen arbeiten, fügen ihre grafischen Ergebnisse zu einem "SPIN Sequence Plot" hinzu
die mit der zu analysierenden Sequenz verknüpft ist. (Eine Ausnahme ist die Einschränkung
Enzymsuche, die ein eigenes separates Fenster erzeugt.) Die meisten Funktionen, die Paare vergleichen
von Sequenzen fügen ihre Ergebnisse zu einem "SPIN Sequence Comparison Plot" hinzu. Die SPIN-Sequenz
Plot und der SPIN-Sequenz-Vergleichs-Plot haben jeweils zugehörige Sequenzanzeigefenster:
die Sequenzanzeige und die Sequenzvergleichsanzeige. Diese ermöglichen den Text der
anzuzeigenden Sequenzen und zeigen Sie mit den Cursorn die entsprechenden Positionen im
grafische Darstellungen. Die grafischen Darstellungen können gezoomt und Cursor oder Fadenkreuz können
verwendet, um die Positionen der einzelnen Ergebnisse zu lokalisieren. Plots können überlagert werden.
OPTIONAL
-Farbkarte: Colormap für das Hauptfenster
-Anzeige:
Zu verwendendes Display
-Geometrie: Ausgangsgeometrie für Fenster
-Name:
Name für die Bewerbung
-sync: Verwenden Sie den synchronen Modus für den Anzeigeserver
-visuell:
Visual für das Hauptfenster
-verwenden: ID des Fensters, in das die Anwendung eingebettet werden soll
--: Übergeben Sie alle verbleibenden Argumente an script
Verwenden Sie Spin online mit den onworks.net-Diensten
