Dies ist die Linux-App namens BADASS, deren neueste Version als badass.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens BADASS with OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
KNALLHART
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BESCHREIBUNG
BADASS ist eine Software mit einer benutzerfreundlichen grafischen Oberfläche, die auf die Suche und Analyse der Bacteriocin-Diversität in Shotgun-Sequenzierungsdaten des gesamten Metagenoms angewendet wird. Die Suche nach Bacteriocin-Sequenzen erfolgt mit Tools wie BLAST oder DIAMOND unter Verwendung der BAGEL4-Datenbank als Referenz. Die identifizierten mutmaßlichen Bacteriocin-Sequenzen werden verwendet, um die Häufigkeit und den Reichtum der drei bisher beschriebenen Klassen zu bestimmen. Die Häufigkeit wird berechnet, indem die als Bacteriocin identifizierten Reads mit den als 16S-rRNA-Gen identifizierten Reads unter Verwendung der SILVA-Datenbank als Referenz verglichen werden. Der Benutzer kann die Hauptparameter der Analyse in der grafischen Oberfläche ändern.
Eigenschaften
- Die Version badass_v1.2 bietet die Möglichkeit, MAC und Windows auszuführen. Neben Linux.
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/badass/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, damit es auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt werden kann.
