Dies ist die Linux-App namens CoDeCZ, deren neueste Version als CoDeCZ_v1.0.1.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens CoDeCZ mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
Ad
CoDeCZ
BESCHREIBUNG
CoDeCZ leitet den Kopienzahlstatus aus gezielten Sequenzierungsdaten auf Gen- oder Exon-Ebene ab.
Die Ergebnisse stellen jedoch KEINE echte Kopienzahl dar, sondern sind halbquantitativ:
Es verwendet den modifizierten Z-Score, um die Abweichung in der normalisierten Abdeckung pro angegebener Region zu berechnen. Je höher der Z-Score,
desto höher die Kopienzahl. Der endgültige Z-Score hängt von der Qualität der Daten und der Zusammensetzung des Referenzpools ab.
Programmiersprache
Unix-Shell
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/codecz/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
