Dies ist die Linux-App namens Covidex, deren neueste Version als Covidex_2021_11_27.rar heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens Covidex mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS:
Covidex
BESCHREIBUNG:
Virale Subtypen oder Kladen repräsentieren Cluster unter Isolaten aus der globalen Population einer definierten Art. Die Subtypisierung ist für Studien zur Virusepidemiologie, -evolution und -pathogenese relevant. In diesem Sinne wurde Covidex als Open-Source-Alignment-freies Machine-Learning-Subtyping-Tool entwickelt. Es ist eine glänzende App, die eine schnelle und genaue Klassifizierung viraler Genome in vordefinierten Clustern ermöglicht. Wenn mehr als 1000 Sequenzen geladen sind, wird das Tool im Multithread-Modus ausgeführt. Kann 16000 Genomsequenzen in weniger als einer Minute klassifizieren (AMD Ryzen 7 1700 8-Core-Prozessor 3 GHz)
Für eine webbasierte Version der App (nur für kleine Datensätze: 100 sek. max.) gehen Sie bitte zu
http://covidex.unlu.edu.ar
Wenn Sie Covidex verwenden, denken Sie bitte daran, den folgenden Vordruck zu zitieren:
https://biorxiv.org/cgi/content/short/2020.08.21.261347v1
Wenn Sie meinen, dass meine Arbeit nützlich ist, können Sie mir einen Kaffee kaufen! https://www.buymeacoffee.com/mcacciabue
Eigenschaften
- Subtypisierung von Sequenzen
- Benutzerfreundliche Oberfläche
- Übersichtsdiagramme
- Portable Version für Windows (keine Installation erforderlich)
- Multithread-Modus
Publikum
Wissenschaft/Forschung, Endbenutzer/Desktop
Programmiersprache
R
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/covidex/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.