Dies ist die Linux-App mit dem Namen denovo_solid_pipeline, deren neueste Version als denovo_solid_pipeline_1.0.1.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens denovo_solid_pipeline mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
denovo_solid_pipeline
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BESCHREIBUNG
denovo_solid_pipeline (DSP) ist eine halbautomatische Pipeline für die kurze Genomassemblierung unter Verwendung von SOLiD-Sequenzierungsdaten. Die Hauptmerkmale der Pipeline sind die Optimierung der Anzahl der Lesekorrekturläufe und der Rechenressourcen durch dynamische Programmierung. DSP hat gegenüber der derzeit verfügbaren Pipeline (denovo2) auch den Vorteil, dass es mehr Contigs generiert, die für weitere Assemblierungsschritte geeignet sind, was die Wahrscheinlichkeit erhöht, Sequenzierungsfehler und/oder polymorphe Stellen zu erkennen.
Publikum
Wissenschaftsforschung
Benutzeroberfläche
Konsole/Terminal
Programmiersprache
Unix-Shell
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/denovosolid/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
